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J-GLOBAL ID：201602209191243220   整理番号：15A1248812

植物の根内部のアーバスキュラー菌根菌コミュニティーの検出に及ぼす種々のPCRプライマーの比較【Powered by NICT】

Comparison of different PCR primers on detecting arbuscular mycorrhizal communities inside plant roots

著者 (7件)： Jiang Shengjing (School of Life Sciences,Lanzhou Univ. MOE Key Lab. of Cell Activities and Stress Adaptations, Gansu, Lanzhou) ,  Shi Guoxi (Coll. of Life Sci. and Technol.,Longdong Univ. Key Univ. Lab. for Protection and Utilization of Longdong ...) ,  Mao Lin (School of Life Sciences,Lanzhou Univ. MOE Key Lab. of Cell Activities and Stress Adaptations, Gansu, Lanzhou) ,  Pan Jianbin (School of Life Sciences,Lanzhou Univ. MOE Key Lab. of Cell Activities and Stress Adaptations, Gansu, Lanzhou) ,  An Lizhe (School of Life Sciences,Lanzhou Univ. MOE Key Lab. of Cell Activities and Stress Adaptations, Gansu, Lanzhou) ,  Liu Yongjun (School of Life Sciences,Lanzhou Univ. MOE Key Lab. of Cell Activities and Stress Adaptations, Gansu, Lanzhou) ,  Feng Huyuan (School of Life Sciences,Lanzhou Univ. MOE Key Lab. of Cell Activities and Stress Adaptations, Gansu, Lanzhou)
資料名： Weishengwu Xuebao  (Weishengwu Xuebao)
巻： 55  号： 7  ページ： 916-925  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2382A  ISSN： 0001-6209  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【目的】コロニー形成根樹枝状菌根菌(AMF)のコミュニティはAMF特異的PCRプライマーを用いた分子法により研究が増加している。しかし,異なって使用したPCRプライマーによる種々の研究を通じたAMF群集の種多様性と種組成を比較することは困難であり,コミュニティ組成の有意差は,異なるプライマーによって特徴づけられる場合もほとんどが知られている。AMFの四プライマーの効率の違いを比較することを目的とした。[方法]著者らは,四種類の通常使用されるAMF特異的プライマーの組合せ(NS31AM1,AML1AML2,NS31AML2とSSUmCf-LSUmBr)を選択し,AMFの多様性と群集を記述するための18S rDNAクローンライブラリーを用いた。[結果]著者らの結果は特異性と被覆率は,試験したプライマー間で異なり,異なるプライマー併用によりAMF群集の種の多様性と組成の異なるパターンが得られるであろうことを示した。SSUmCf-LSUmBr増幅AMF配列における最良の特異性と被覆,次いでNS31AML2とNS31AM1であった,AML1AML2はAMF配列に向けて最も低い特異性を示した。[結論]SSUmCf-LSUmBrは限られた参照配列と大きなDNAサイズのために現段階でAMF群集研究のための最適なプライマー対ではない。alternative,NS31AML2はAMF群集研究でより適切であるとして,その標的rDNA領域はますます使用される仮想分類学データベース(http://maarjam。植物学ut.ee)と良く一致したので,適したDNAサイズハイスループット塩基配列決定法の効率的に使用することができた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 群集 ,  データベース ,  *プライマ【塗装】 ,  生物多様性 ,  DNA【核酸】 ,  *根
準シソーラス用語： 分類学 ,  リボソームDNA ,  特異性 ,  クローンライブラリー ,  18S rDNA ,  有意差 ,  種組成 ,  コロニー形成 ,  *アーバスキュラー菌根菌 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 植物 ,  根 ,  アーバスキュラー菌根菌 ,  コミュニティー ,  PCRプライマー