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J-GLOBAL ID：201602209695833109   整理番号：16A0231638

エクソンレベルでのエンリッチメント解析におけるエクソン数に起因するバイアスの補正

Correction of the Bias Derived from the Number of Exons in Exon-Level Enrichment Analysis

著者 (2件)： 法隆大輔 (農業・食品産業技術総合研究機構 中央農業総合研究セ) ,  林武司 (農業・食品産業技術総合研究機構 中央農業総合研究セ)
資料名： 計量生物学  (Japanese Journal of Biometrics)
巻： 36  号： 2  ページ： 63-84  発行年： 2016年01月31日 
JST資料番号： L1096A  ISSN： 0918-4430  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： エクソンの発現量の差異をもとに遺伝子数を用いたエンリッチメン...

シソーラス用語： エキソン ,...

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分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  統計学  (AB08000H)

引用文献 (24件)：

• Anders, S., Reyes, A., and Huber, W. (2012). Detecting differential usage of exons from RNA-seq data. Genome Research, 22, 2008-2017.
• Benjamini, Y., and Hochberg, Y. (1995). Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing. Journal of the Royal Statistical Society. Series B, 57, 289-300.
• Bullard, J. H., Purdom, E., Hansen, K. D., and Dudoit, S. (2010). Evaluation of statistical methods for normalization and differential expression in mRNA-Seq experiments. BMC bioinformatics, 11, 94.
• Dillies, M. A., Rau, A., Aubert, J., Hennequet-Antier, C., Jeanmougin, M., Servant, N., Keime, C., Marot, G., Castel, D., Estelle, J., et al. (2013). A comprehensive evaluation of normalization methods for Illumina high-throughput RNA sequencing data analysis. Briefings in bioinformatics, 14, 671-683.
• Dolatshad, H., Pellagatti, A., Fernandez-Mercado, M., Yip, B. H., Malcovati, L., Attwood, M., Przychodzen, B., Sahgal, N., Kanapin, A. A., Lockstone, H., et al. (2015). Disruption of SF3B1 results in deregulated expression and splicing of key genes and pathways in myelodysplastic syndrome hematopoietic stem and progenitor cells. Leukemia, 29, 1092-1103.

タイトルに関連する用語 (4件)： エクソン ,  エンリッチメント解析 ,  起因 ,  バイアス