ラット心筋細胞における低酸素プレコンディショニングにより誘導される差次的に発現したmiRNAのスクリーニングとバイオインフォマティクス解析【Powered by NICT】

He Shufang; Zhu Haijuan; Cheng Jie; Xu Shijing; Yan Wan; Zhagn Ye

文献

J-GLOBAL ID：201602211255245250 整理番号：15A1252249

ラット心筋細胞における低酸素プレコンディショニングにより誘導される差次的に発現したmiRNAのスクリーニングとバイオインフォマティクス解析【Powered by NICT】

Screening and bioinformatics analysis of differentially expressed miRNAs induced by hypoxia preconditioning in rat cardiomyocytes

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資料名：
巻： 31 号： 7 ページ： 940-944 発行年： 2015年
JST資料番号： C2291A ISSN： 1001-1978 CODEN： ZYTOE8 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

目的は成体ラット心筋細胞における低酸素プレコンディショニング(HPC)により誘起された差次的に発現したマイクロRNA(miRNA)をスクリーニングして,miRNA調節標的遺伝子とその機能を予測するために。方法心筋細胞は成体ラット心室心筋から分離し,培養(in vitro)であった。細胞を2群:対照群(CON)と低酸素プレコンディショニング(HPC)に分けた。HPC群で心筋細胞は,10分間の低酸素症の後に30分間の再酸素化を行ったが,CON群の細胞は正常な条件下で培養した。後,全RNAは抽出した後,特異的に発現するmiRNAをスクリーニングするためのmiRNAマイクロアレイを行った。マイクロアレイ結果は,定量的RT-PCR(qRT-PCR)によって検証した。バイオインフォマティクス解析は,miRNA調節された標的遺伝子を予測し,強化遺伝子オントロジー(GO)とシグナル伝達経路(経路)を解析した。結果HPCはCON群と比較して,心筋細胞におけるmiRNA発現の有意な変化を引き起こした。総数12のmiRNAsがアップレギュレートされ,14のmiRNAは,ダウンレギュレートされた(P <0.01, FDR < 0. 05)。蛍光信号強度>500の差次的に発現した7のmiRNAsは,バイオインフォマティクス解析のために選択した。qRT-PCRにより検出されたmiR133b5p,miR-664-1-5pとmiR6216の発現は,マイクロアレイ結果において示されたものとアップレギュレーションまたはダウンの類似したパターンを示した。バイオインフォマティクス解析は,miRNA調節標的遺伝子は27GOと6シグナル経路における顕著に濃縮していたことを明らかにした。結論はラット心筋細胞におけるmiRNAの発現プロファイルは,HPCに大きく影響された。これらの差次的に発現したmiRNAはラット心筋細胞におけるそれらの標的遺伝子を調節することにより,HPC誘導心臓保護に関与している。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

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循環系の基礎医学 , 薬理学一般

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