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J-GLOBAL ID：201602211894717212   整理番号：16A1122948

PINUS TABULAEFORMISの胚珠のマイクロサテライト特性を解析した。【JST・京大機械翻訳】

Characterization of microsatellites of ovule transcriptome in Pinus tabulaeformis

著者 (4件)： An Jun (College of Biological Sciences and Technology,Beijing Forestry University) ,  Zheng Caixia (College of Biological Sciences and Technology,Beijing Forestry University) ,  Yao Yang (College of Biological Sciences and Technology,Beijing Forestry University) ,  Chen Binli (College of Biological Sciences and Technology,Beijing Forestry University)
資料名： Beijing Linye Daxue Xuebao  (Beijing Linye Daxue Xuebao)
巻： 38  号： 5  ページ： 77-83  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2404A  ISSN： 1000-1522  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本稿では,マイクロサテライトマーカー技術を用いて,PINUS TABULAEFORMISの胚珠発達に対する分子調節機構およびマイクロサテライトの影響を研究するために,以前のハイスループット配列決定の結果に基づき,MISAソフトウェアを用いて得られたトランスクリプトームデータを分析した。それは,将来の研究のための重要な情報資源とデータ保障を提供する。得られた412個のSSR遺伝子座は1個の配列に存在し、平均2.15KBに一つのSSRが現れた。 の胚珠には87種の反復モチーフがあり、そのうち(A/T)Nの割合が最も高く、約45.89%を占める。出現頻度の高い反復型はモノヌクレオチド(%)とトリヌクレオチド(34.99)の重複である。得られたマイクロサテライトは長さ<20BPの短い反復配列であり、≧20BPは総数の%%を占め、反復配列の出現頻度は長さと負の相関があった。得られたSSR遺伝子座の大部分は非コード領域に位置し、コード領域に位置するのは232個であり、18個はコード領域と非翻訳領域にまたがる。コード領域の割合が最も高いのはトリヌクレオチド反復配列(105個,45.26%)であった。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ソフトウェア
準シソーラス用語： 出現頻度 ,  情報資源 ,  ハイスループット ,  マイクロサテライトマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Pinus tabulaeformis ,  ovule ,  transcription ,  microsatellite

分類 (3件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (4件)： Pinus ,  胚珠 ,  マイクロサテライト ,  解析