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J-GLOBAL ID：201602214139052533   整理番号：15A1301611

SSR(単純配列反復)マーカーのためのプライマーのスクリーニングと絶滅危惧植物Magnolia officinalisの反応システムの最適化【Powered by NICT】

Screening of Primers for SSR Markers and Optimization of Reaction System for Endangered Plant Magnolia officinalis

著者 (6件)： Mai Jing (Res. Inst. of Subtropical Forestry, Chinese Acad. of Forestry, Key Lab. of Tree Breeding of Zhejiang Province, Fuyang) ,  Yang Zhiling (Res. Inst. of Subtropical Forestry, Chinese Acad. of Forestry, Key Lab. of Tree Breeding of Zhejiang Province, Fuyang) ,  Yang Xu (Res. Inst. of Subtropical Forestry, Chinese Acad. of Forestry, Key Lab. of Tree Breeding of Zhejiang Province, Fuyang) ,  Chen Hui (Res. Inst. of Subtropical Forestry, Chinese Acad. of Forestry, Key Lab. of Tree Breeding of Zhejiang Province, Fuyang) ,  Liu Qisheng (Anhua Forestry Bureau, Hunan Province, Anhua) ,  Liao Haijun (Anhua Forestry Bureau, Hunan Province, Anhua)
資料名： Shengtai yu Nongcun Huanjing Xuebao  (Shengtai yu Nongcun Huanjing Xuebao)
巻： 31  号： 4  ページ： 600-607  発行年： 2015年 
JST資料番号： W1486A  ISSN： 1673-4831  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： Magnolia officinalisのためのSSR PCR(単純配列反復固定されたポリメラーゼ連鎖反応)のための最適条件の探索するために,PCR(DNAテンプレート,プライマー,Mg~(2+),dNTP)とTaqポリメラーゼ)に影響する五因子は,SSRプライマーのスクリーニングに基づいた直交実験設計を用いて四レベルに最適化した。Magnolia officinalisとその近縁種から分離したプライマーの70対のうち13対は異なる増幅バンドと豊富な多形を抽出した。種々のレベルでPCRシステムへの影響に関しては,五因子はプライマー>Taq enzymecatalytic放射能濃度>Mg~(2+)>dNTP>鋳型DNAの順を示した。SSR(単純配列反復)解析のための最適PCRシステムは2ng/μL~(-1)であった鋳型DNAと25μL~(-1)システム,0.6μL~(-1),Mg~(2+)濃度2.0mmol・L-1~(-1)であったプライマー,dNTP濃度0.5mmol・L-1~(-1)とTaqポリメラーゼ0.03UμL~(-1)を,94°Cで4分predenaturation,94°Cでの変性の30秒,焼なましの30秒48.0-59.0°C(プライマーに依存した焼なまし温度)30秒で,72°Cにおける伸展の1分,先行過程の35サイクル後に72°Cで10分拡張のからなる最良増幅プログラムした。以上の所見は,絶滅危惧種,Magnolia officinalisの集団遺伝学と分子生態学の研究におけるSSR PCR技術を使用するためのいくつかの技術的パラメータを提供するかもしれない。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 焼なまし ,  反応系 ,  集団遺伝 ,  DNA【核酸】 ,  *プライマ【塗装】 ,  実験計画法 ,  最適化 ,  鋳型【遺伝】 ,  PCR法 ,  最適条件
準シソーラス用語： 焼きなまし温度 ,  近縁種 ,  Taqポリメラーゼ ,  *絶滅危惧植物 ,  *Magnolia officinalis , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 環境問題  (SA01020V) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A)

タイトルに関連する用語 (9件)： SSR ,  反復 ,  マーカー ,  プライマー ,  スクリーニング ,  絶滅危惧植物 ,  Magnolia ,  反応システム ,  最適化