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J-GLOBAL ID：201602217831700012   整理番号：16A0087753

赤白鯉(Cyprinus carpio var.コイ)におけるGTPシクロヒドロラーゼ1遺伝子(Gch1)の発現と進化的解析【Powered by NICT】

Expression and Evolutionary Analysis of GTP Cyclohydrolase 1 Gene (Gch1) in Red-white Koi Carp (Cyprinus carpio var. koi)

著者 (6件)： Li Xiaomin (Coll. of Fisheries and Life Sci., Dalian Ocean Univ., Dalian) ,  Li Jiongtang (The Center for Applied Aquatic Genomics, Chinese Acad. of Fishery Sciences, Beijing) ,  Xiao Guibao (Coll. of Fisheries and Life Sci., Dalian Ocean Univ., Dalian) ,  Song Yingnan (The Center for Applied Aquatic Genomics, Chinese Acad. of Fishery Sciences, Beijing) ,  Wang Xiuli (Coll. of Fisheries and Life Sci., Dalian Ocean Univ., Dalian) ,  Sun Xiaowen (The Center for Applied Aquatic Genomics, Chinese Acad. of Fishery Sciences, Beijing)
資料名： Nongye Shengwu Jishu Xuebao  (Nongye Shengwu Jishu Xuebao)
巻： 23  号： 7  ページ： 945-952  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2715A  ISSN： 1674-7968  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： プテリジン経路はゼブラフィッシュにおける赤色プテリジン色素(Danio rerio)に黄色の合成を調節する。GTPシクロヒドロラーゼ1(Gch1)はこの経路の律速酵素であることが分かった。コイ(Cyprinus carpio var.koi)は様々な色模様を有する最も広範な養殖魚の一つである。コイの異なる色でGch1の機能保存と発現パターンを調べるために,本研究はコイ(Cyprinus carpio)の集合したトランスクリプトームに基づく全長Gch1cDNA(GenBank No. KP056544)を増幅した。保存されたGTPシクロハイドロラセイドマインを持つ251アミノ酸の蛋白質コンスイストセド。遺伝子オントロジーの注釈はGch1はヒドロラーゼ活性,窒素化合物代謝プロセスとアミノ酸代謝プロセスに関与することを示した。ホモログ探索は脊椎動物全体での高い保存を見出した。適応進化分析はコイとゼブラフィッシュの間Gch1の同義あたりの非同義部位(Ka),同義置換の数あたりの非同義置換の数(Ks)の比は0.06であった,これは負の選択下にあったことを示した。これらの結果はGch1はコイにおけるプテリジン経路に関与することを示した。差異的発現分析は白色皮膚よりも赤色皮膚でGch1の有意に高いレベル(P<0.05)を明らかにし,Gch1あるの高発現は皮膚色を赤色に変わることを示した。本研究はコイにおける赤色と白色皮膚間Gch1の異なる発現を明らかにし,脊椎動物,他の魚における色素沈着機構の研究に有用であることを示し,これはGch1の保全を見出した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 脊椎動物 ,  色素 ,  皮膚 ,  アミノ酸代謝 ,  トランスクリプトーム ,  *ヒドロラーゼ ,  *コイ ,  魚類 ,  アミノ酸 ,  ゼブラフィッシュ
準シソーラス用語： 非同義置換 ,  同義置換 ,  ホモログ ,  遺伝子オントロジー ,  養殖魚 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (10件)： 赤 ,  白 ,  鯉 ,  Cyprinus ,  コイ ,  GTPシクロヒドロラーゼ ,  遺伝子 ,  発現 ,  進化 ,  解析