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J-GLOBAL ID：201602218947840544   整理番号：16A0048252

ゲノムスケールの代謝ネットワークの批判的評価 統一的基準の必要性

Critical assessment of genome-scale metabolic networks: the need for a unified standard

著者 (2件)： RAVIKRISHNAN Aarthi (Indian Inst. Technol. Madras) ,  RAMAN Karthik (Indian Inst. Technol. Madras)
資料名： Briefings in Bioinformatics  (Briefings in Bioinformatics)
巻： 16  号： 6  ページ： 1057-1068  発行年： 2015年11月 
JST資料番号： W2342A  ISSN： 1467-5463  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 公表済みの約100種類のゲノムスケール代謝ネットワークおよび対応する制約ベースモデルについて調べた。多くのモデルにおいて,標準的な識別子を利用するアノテーションが欠如し,反応フラックスに対する制約およびシミュレーションに用いる目的関数に関する明確な情報が不足していることが分かった。これらの結果から,ゲノムスケールの代謝系再構築のための広く受け入れ可能な統一的基準の必要性が明らかになった。厳格な統一的基準を用いることにより,再構築のプロセスが合理化され,再構築された代謝モデルの質が改善されることが示唆された。

シソーラス用語： *ゲノム ,  ネットワーク ,  評価 ,  標準 ,  *再構成 ,  モデル ,  *シミュレーション ,  目的関数 ,  アノテーション
準シソーラス用語： *基準 ,  *識別子 ,  *代謝ネットワーク ,  代謝系

分類 (3件)： 代謝一般  (EB02030C) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： ゲノム ,  スケール ,  代謝ネットワーク ,  評価