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J-GLOBAL ID：201602236253384913   整理番号：16A0317015

Nycticebus pygmaeusの糞便マイクロバイオームからのフェノールヒドロキシラーゼとカテコール1,2-ジオキシゲナーゼの解析遺伝子多様性【Powered by NICT】

Analysis gene diversity of phenol hydroxylase and catechol 1,2-dioxygenase from fecal microbiome of Nycticebus pygmaeus

著者 (10件)： Xiong Caiyun (School of Life Sciences, Yunnan Normal Univ., Yunnan, Kunming) ,  Xu Bo (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...) ,  Dai Liming (School of Life Sciences, Yunnan Normal Univ., Yunnan, Kunming) ,  Li Junjun (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...) ,  Tang Xianghua (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...) ,  Mu Yuelin (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...) ,  Yang Yunjuan (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...) ,  Zhou Junpei (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...) ,  Ding Junmei (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...) ,  Huang Zunxi (School of Life Sciences, Yunnan Normal University; Engineering Res. Center of Sustainable Dev. and Utilization of ...)
資料名： Weishengwuxue Tongbao  (Weishengwuxue Tongbao)
巻： 42  号： 11  ページ： 2189-2197  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2731A  ISSN： 0253-2654  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]フェノールヒドロキシラーゼとカテコール1,2-ジオキシゲナーゼの遺伝子多様性はNycticebus pygmaeusの糞便ミクロビオームから調べた。[方法]縮退プライマーはメタゲノムDNA由来のフェノールヒドロキシラーゼとカテコール1,2-ジオキシゲナーゼ遺伝子断片を増幅するために使用した。フェノールヒドロキシラーゼとカテコール1,2-ジオキシゲナーゼ遺伝子クローンライブラリーを構築し,クローンのいくつかは別々に配列決定した。[結果]フェノールヒドロキシラーゼとカテコール1,2-ジオキシゲナーゼ配列のBLAST分析はGenBankの既知フェノールヒドロキシラーゼとカテコール1,2-ジオキシゲナーゼ配列に92%~-100%と87%~-100%の同一性を示した。系統発生分析は,遺伝子クローンライブラリーでのフェノールヒドロキシラーゼ配列はNeisseria,Burkholderia,Alcaligenes,Acinetobacter由来のフェノールヒドロキシラーゼ配列と高い類似性を持つことを示した。遺伝子クローンライブラリーにおいてカテコール1,2-ジオキシゲナーゼ配列はAcinetobacterからカテコール1,2-ジオキシゲナーゼ配列と高い類似性を持っていた。配列アラインメントは,LmPH配列の2DEXRHモチーフはフェノールヒドロキシラーゼ配列で検出され,保存されたシステインは,Ag~+とHg~(2+)により阻害されたがカテコール1,2-ジオキシゲナーゼ配列で検出した。[結論]Nycticebus pygmaeusの糞便マイクロバイオームからのフェノールヒドロキシラーゼは多成分フェノールヒドロキシラーゼ,フェノール分解の中間生産はオルト経路によるカテコール1,2-ジオキシゲナーゼにより開裂され得るカテコールであった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： Acinetobacter ,  遺伝子 ,  DNA【核酸】 ,  クローン ,  類似性 ,  *糞便 ,  多価フェノール
準シソーラス用語： 配列アライメント ,  系統解析 ,  GenBank ,  BLAST ,  クローンライブラリー ,  遺伝多様性 ,  *カテコール1,2-ジオキシゲナーゼ ,  *フェノールヒドロキシラーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C) ,  植物の生化学  (EH01050J) ,  下水,廃水の生物学的処理  (SC03060H)

物質索引 (1件)： カテコール

タイトルに関連する用語 (9件)： Nycticebus ,  糞便 ,  マイクロバイオーム ,  フェノールヒドロキシラーゼ ,  カテコール ,  ジオキシゲナーゼ ,  解析 ,  遺伝子 ,  多様性