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J-GLOBAL ID：201602238207389287   整理番号：16A1017006

烏珠穆沁ヒツジRIPK2遺伝子の多型と成長形質との関連【JST・京大機械翻訳】

Association of the RIPK2 Gene Genetic Variation with Ujumqin Sheep Growth Traits

著者 (11件)： Ma Xiaomeng (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Xuan Junli (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wang Huihua (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Yuan Zehu (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wu Mingming (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhu Caiye (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Ruizao (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wei Caihong (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhao Fuping (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Du Lixin (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Li (Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Zhongguo Nongye Kexue  (Zhongguo Nongye Kexue)
巻： 49  号： 7  ページ： 1391-1407  発行年： 2016年 
JST資料番号： W1459A  ISSN： 0578-1752  CODEN： CKNYAR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】前期ヒツジの産肉性状のGWAS研究結果に基づく,烏珠穆沁,ヒツジ成長形質に及ぼすRIPK2遺伝子の影響を検討する目的は,この遺伝子におけるヒツジ成長形質と関連する分子マーカーを見つけるために,同時にGWASの結果に対して検証を行った。【方法】烏珠穆沁の343匹のヒツジの試験個体群においては,その中の30個の個体の血液DNAサンプルを選び,同じ濃度でDNAプールを構成する,RIPK2遺伝子のエキソンおよびその上流および下流の1 000BPの制御領域に対してPCR増幅を実施するために,プライマーを設計した,PCR生成物の検出は,目的バンドであった後に配列化した。DNAMANと2CHROMAS測序峰図を用いて分析を行う,飛行質量分析法を採用し,検出されたSNPおよび前期GWASによって得られたSNPに対して遺伝子座の遺伝子型をタイピングを行った。HAPLOVIEWソフトウェアを用いて多形性遺伝子座についてハプロタイプ及び連鎖不均衡分析を構築した。SPSS(22.0)ソフトウェアを用いてRIPK2遺伝子SNP部位と成長形質間の相関分析を行った。【結果】4つの多形性部位を発見する共,A5536Gの同義突然変異RS01第4エキソン内の,3つの遺伝子型がこの位点で検出され位置し,AG遺伝子型頻度はAA遺伝子型の頻度はそれぞれ0.42と0.45であり,GG遺伝子型の頻度は0.13であり,優位性等対立遺伝子のためA,その周波数は0.65であった;その中には,エキソン7にT8952Cミスセンス突然変異RS02が検出され,この突然変異は3つの遺伝子型が検出された部位は,TT遺伝子型の周波数は0.82であったが,TC遺伝子型頻度は0.16であり,CC遺伝子型頻度は0.02であり,Tは優勢な対立遺伝子であり,遺伝子頻度は0.9であった;,TTは2つの遺伝子型とCC)がこの位点で検出され,ヘテロ接合体遺伝子型は検出されなかった。CC遺伝子型頻度は,TT遺伝子型の周波数は0.25であるが,エキソン10においてT2836Cの突然変異はRS05が検出された,0.75;であった。上流の調節領域は1つのG5181Cの突然変異はRS30を発見し,3つの遺伝子型があり,そのうちGC遺伝子型の頻度はは0.50であり,CC遺伝子型頻度は0.18であり,GG遺伝子型の頻度は0.32であり,Gは優勢対立遺伝子であり,その頻度は0.58であった;GWASによって得られたSNP部位がT4456Cであることを示し,本研究においてRS34と命名された,このビットは点に3つの遺伝子型があり,その中にはTTの遺伝子型頻度は0.49であったが,TC遺伝子型頻度は0.37であり,CCの遺伝子型頻度は0.14であった。優性T対立遺伝子の頻度は0.68であった。発見Χ2適合度検定,RS34を除いて,すべての残りの部位はHARDY-WEINBERG平衡状態(P>0.05)にあった。RS02は低度の多型(PIC<0.25)にあり,残りは部位多型情報含量(0.25<PIC<0.5)にある。連鎖不平衡解析の結果,RS01と02RSが強い連鎖,集団の中で3つのハプロタイプを構築し,ATは優勢ハプロタイプであり,その周波数は0.645であり,この2つの遺伝子座では共6つの遺伝子型の組合せを構築し,その中などで優勢の遺伝子型の組み合わせであり,頻度は0.425であった。単一マーカー関連分析は示した:RS01のAG遺伝子型AAの個体とGG遺伝子型の個体は4月齢の体重、胸囲上差異が顕著である(P<0.05),6カ月の高、胸囲に差が著しかった(P<0.05)。4月齢の体重、体高、胸囲と6月齢胸寛上、TC,TT遺伝子型(P<0.05)より顕著に優れた月齢体高6と4月齢体斜長斜長、体斜長において,RS02位点CC遺伝子型を有する個体は極めて著しいTT、TC遺伝子型の個体(P<0.01)より優れていた。RS30位の点上で,GG遺伝子型の個体は4月齢の体重、胸囲と他の2つの遺伝子型間の二つの差異は顕著であった(P<0.05),3つの遺伝子型の個体は6月齢胸囲においていずれも有意差(P<0.05)があった。RS34位の点の3つの遺伝子型の個体のみが,4月齢体重上は有意差があった(P<0.05)。RS01-02の組合せの遺伝子型の関連分析,発見した:RSGGCC遺伝子型の組み合わせの個体は4月齢体重、体高、体斜長、胸囲において他の遺伝子型との間の差が有意であった(P<0.05)。GGCC遺伝子型の組み合わせの個体は6カ月の高斜長、体斜長、胸幅上では他の遺伝子型との組合せの個体差は,有意であった(P<0.05)。【結論】RIPK2遺伝子はヒツジ成長形質には有意な影響があり,そのSNPSは分子マーカーの烏珠穆沁ヒツジ成長形質としの選別育成に対して一定の指導意義を持つ。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノムワイド関連解析 ,  遺伝子頻度 ,  PCR法 ,  対立遺伝子 ,  個体群 ,  遺伝子型 ,  体重 ,  ミスセンス突然変異 ,  ハプロタイプ ,  DNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  個体差 ,  突然変異 ,  胸囲 ,  分子マーカー ,  遺伝 ,  集団遺伝

著者キーワード (5件)： RIPK2 gene ,  growth traits ,  polymorphisms ,  association ,  Ujumqin sheep

分類 (3件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  花き・花木  (FC03044O) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： ヒツジ ,  RIPK2 ,  遺伝子 ,  多型 ,  成長形質