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J-GLOBAL ID：201602238434323579   整理番号：16A1100568

ループ媒介等温増幅法(LAMP法)を用いる感染したイチゴ植物におけるColletotrichum gloeosporioidesの迅速検出

Rapid detection of Colletotrichum gloeosporioides in infected strawberry plants using loop-mediated isothermal amplification

著者 (4件)： Katoh Hiroshi (Center for Bioscience Research and Education, Utsunomiya University, Utsunomiya, Tochigi, Japan) ,  Fukuda Takashi (Tochigi Prefectural Agricultural Experiment Station, Utsunomiya, Tochigi, Japan) ,  Nishigawa Hisashi (Faculty of Agriculture, Utsunomiya University, Utsunomiya, Tochigi, Japan) ,  Natsuaki Tomohide (Faculty of Agriculture, Utsunomiya University, Utsunomiya, Tochigi, Japan)
資料名： Journal of General Plant Pathology  (Journal of General Plant Pathology)
巻： 82  号： 4  ページ： 190-198  発行年： 2016年07月 
JST資料番号： L3961A  ISSN： 1345-2630  CODEN： NSBGAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イチゴ植物で炭疽病を引き起こす,Colletotrichum gloeosporioidesを検出するために,ループ媒介等温増幅法(LAMP)分析を開発した。プライマ集合は,遺伝子コード化5.8S rRNAから,内部転写スペーサー2までの領域を標的とした,そしてそれを,GenBankで25のColletotrichum種で保存した。LAMP分析は,これはマイクロ波照射を用いて調製した鋳型DNAを使用するが,感染したイチゴ植物でC.gloeosporioidesを検出するための簡単で敏感な道具であることを,本結果は示した。さらに,本結果は,LAMP分析が,Colletotrichum種,例えばC.acutatum,C.aenigmaおよびC.aenigma,を識別できたことを示した。Copyright 2016 The Phytopathological Society of Japan and Springer Japan Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *遺伝学実験技術 ,  *イチゴ属 ,  *Colletotrichum ,  プライマー【遺伝】 ,  rRNA ,  ヌクレオチド配列 ,  データベース ,  マイクロ波照射
準シソーラス用語： *LAMP法 ,  5.8S rRNA ,  内部転写スペーサー2 ,  GenBank ,  Colletotrichum acutatum

著者キーワード (6件)： Strawberry anthracnose ,  Early diagnosis ,  Colletotrichum gloeosporioides ,  Colletotrichum acutatum ,  Colletotrichum aenigma ,  Colletotrichum siamense

分類 (3件)： 果樹  (FC03042G) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  物理的防除一般  (FC05041D)

引用文献 (43件)：

• Afanador-Kafuri L, Minz D, Maymon M, Freeman S (2003) Characterization of Colletotrichum isolates from tamarillo, passiflora, and mango in Colombia and identification of a unique species from the genus. Phytopathology 93:579-587
• Aljanabi SM, Forget L, Dookun A (1999) An improved and rapid protocol for the isolation of polysaccharide- and polyphenol-free sugarcane DNA. Plant Mol Biol Rep 17:281
• Baroncelli R, Zapparata A, Sarrocco S, Sukno SA, Lane CR, Thon MR, Vannacci G, Holub E, Sreenivasaprasad S (2015) Molecular diversity of anthracnose pathogen populations associated with UK strawberry production suggests multiple introductions of three different Colletotrichum species. PLoS One 10:e0129140
• Boubourakas IN, Fukuta S, Kyriakopoulou PE (2009) Sensitive and rapid detection of peach latent mosaic viroid by the reverse transcription loop-mediated isothermal amplification. J Virol Method 160:63-68
• Capobiango NP, Pinho DB, Zambolim L, Pereira OL, Lopes UP (2015) Anthracnose on strawberry fruits caused by Colletotrichum siamense in Brazil. Plant Dis 100:859

タイトルに関連する用語 (7件)： ループ ,  増幅 ,  LAMP法 ,  感染 ,  イチゴ ,  植物 ,  Colletotrichum