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J-GLOBAL ID：201602250497816226   整理番号：16A1016308

ブタ流行性下痢ウイルス湖北株の分離同定およびそのS1遺伝子の進化分析は【JST・京大機械翻訳】

Phylogenetic Analysis of s1 Gene from a Newly Isolated Strain of Porcine Epidemic Diarrhea Virus

著者 (12件)： Gui Rui (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Guo Rui (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Tian Yongxiang (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Li Wenhao (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Cai Hang (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Duan Zhengying (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Yang Keli (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Liu Zewen (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Yuan Fangyan (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Liu Wei (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Xing Cuiyu (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding) ,  Zhou Danna (Animal Husbandry and Veterinary Institute,Hubei Academy of Agricultural Science/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding)
資料名： Hubei Nongye Kexue  (Hubei Nongye Kexue)
巻： 55  号： 6  ページ： 1506-1510  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2087A  ISSN： 0439-8114  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ブタ流行性下痢ウイルス(PORCINE EPIDEMIC DIARRHEA VIRUS,PEDV)はブタでは腸管感染症の病原体は,主に、子豚の嘔吐と下痢の脱水を引き起こし,1週齢以内の哺乳子豚の被害が最も深刻であり,,死亡率は50%~100%に達することができる。VERO細胞を用いて86細胞は湖北省のあるブタ場から下痢子豚の小腸組織におけるウイルスの1株を単離し,RT-PCRで検出し、配列アラインメント後にそのはPEDVに決定,HBと201503株を命名した。PEDV S1遺伝子の全長の増幅プライマーを設計し,この株のウイルスのS1遺伝子の全長配列を獲得しそして進化分析を行った,結果はこの毒株と近年GENBANK登録のPEDV S1遺伝子のヌクレオチド配列類似性は91.4%~99.2%,示す。とワクチン株CV777との類似性は比較的低く,わずか91.8%であった。S1遺伝子の進化樹分析によりHB201503及び最近数年の国内分離株は主にI番目のサブセットに集中しており,高いかつHB201503株と406183(2014,四川省)KMとKM609206(2015,江蘇省)と相同性を示した。また,S1蛋白質のアミノ酸配列アラインメントを示す,HB201503と最近数年分離株およびワクチン株CV777いずれも55-74 157-163位アミノ酸の連続する4つ以上のアミノ酸の欠失が出現した置換または,また201503株HB及びCV777の最近数年の分離株と比較して,また270-283位のアミノ酸に1個のアミノ酸の欠失と10個のアミノ酸の置換がが出現した。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 乳児 ,  アミノ酸 ,  死亡率 ,  *ウイルス ,  相同性 ,  ヌクレオチド配列 ,  RT-PCR法 ,  類似性 ,  *下痢 ,  分離株 ,  ワクチン株 ,  配列アライメント ,  *S1遺伝子 ,  *ブタ流行性下痢ウイルス ,  仔ブタ ,  子供 ,  *微生物
準シソーラス用語： 子豚 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Porcine epidemic diarrhea virus ,  isolation and identification ,  s1 gene ,  phylogenetic analysis

分類 (2件)： 豚  (FD02040U) ,  ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

タイトルに関連する用語 (6件)： ブタ流行性下痢ウイルス ,  株 ,  同定 ,  S1遺伝子 ,  進化 ,  分析