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J-GLOBAL ID：201602251291027244   整理番号：16A0324484

Nocardia種の同定における16S rDNA配列法の評価【Powered by NICT】

Evaluation of 16S rDNA sequence method in identification of Nocardia species

著者 (6件)： Li Luxi (School of Lab. Medicine, Wenzhou Medical Univ. / Key Lab. of Lab. Medicine, Ministry of Education of China; Stat Key ...) ,  Zhang Yuanyuan (Stat Key Lab. for Infectious Disease Control and Prevention,National Inst. for Communicable Disease Control and ...) ,  Liu Haican (Stat Key Lab. for Infectious Disease Control and Prevention,National Inst. for Communicable Disease Control and ...) ,  Tan Xiaoluo (Stat Key Lab. for Infectious Disease Control and Prevention,National Inst. for Communicable Disease Control and ...) ,  Li Zhenjun (Stat Key Lab. for Infectious Disease Control and Prevention,National Inst. for Communicable Disease Control and ...) ,  Lou Yongliang (School of Lab. Medicine, Wenzhou Medical Univ. / Key Lab. of Lab. Medicine, Ministry of Education of China, Wenzhou)
資料名： Zhongguo Renshougonghuanbing Xuebao  (Zhongguo Renshougonghuanbing Xuebao)
巻： 31  号： 11  ページ： 1017-1022  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2253A  ISSN： 1002-2694  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的は,Nocardia種の同定のための16S rDNA配列分析法の価値を評価することである。本研究では,ポリメラーゼ鎖反応(PCR)により増幅した49Nocardia株を決定と精製物はさらなる分析のための直接配列を決めた。一方,GenBankから32Nocardia16S rDNA配列は,補充のためのダウンロードした。DNA STARソフトウエアは選択された配列を解析し,配列対の比率の類似性を計算した。クラスタ分析の系統樹は,Mega6.06ソフトウェアによって構築した。Nocardia種間の16S rDNA配列はNocardia複合体(N.africana,N.veteranaとN.kruczakiae)配列は高度に一貫した高度が多。16S rDNA配列類似性は100%~99.1%に達した;。配列対間の類似性は95.7%から99.8%であった。結論として,16S rDNA配列分析は,迅速,簡単かつ特異的手法,種レベルにNocardia株を同定することである。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： クラスタ分析 ,  *DNA【核酸】 ,  系統樹 ,  PCR法 ,  ソフトウェア ,  *Nocardia ,  複合体 ,  類似性
準シソーラス用語： *リボソームDNA ,  GenBank ,  配列解析 ,  *16S rDNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： Nocardia ,  同定 ,  rDNA ,  評価