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J-GLOBAL ID：201602258431488617   整理番号：16A1309513

心疾患:エキソーム塩基配列決定によって同定された症候性および非症候性の先天性心疾患の異なる遺伝学的構造

Distinct genetic architectures for syndromic and nonsyndromic congenital heart defects identified by exome sequencing

著者 (100件)： SIFRIM Alejandro (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  HITZ Marc-Phillip (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  TURKI Saeed H Al (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  MCRAE Jeremy (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  FITZGERALD Tomas W (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  SINGH Tarjinder (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  SWAMINATHAN Ganesh Jawahar (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  PRIGMORE Elena (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  RAJAN Diana (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  COLGIU Irina-Gabriela (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  DALY Allan (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  DANESH John (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  OUWEHAND Willem H (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  POLLARD Martin O (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  WRIGHT Caroline F (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  BARRETT Jeffrey C (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  HURLES Matthew E (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  HITZ Marc-Phillip (Universitaetsklinikum Schleswig-Holstein Kiel, Kiel, DEU) ,  HOFF Kirstin (Universitaetsklinikum Schleswig-Holstein Kiel, Kiel, DEU) ,  KAHLERT Anne-Karin (Universitaetsklinikum Schleswig-Holstein Kiel, Kiel, DEU) ,  KRAMER Hans-Heiner (Universitaetsklinikum Schleswig-Holstein Kiel, Kiel, DEU) ,  HITZ Marc-Phillip (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  BERGER Felix (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  HOFF Kirstin (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  KAHLERT Anne-Karin (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  KRAMER Hans-Heiner (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  KLAASSEN Sabine (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  WILSDON Anna (Univ. Nottingham, Nottingham, GBR) ,  KETLEY Ami (Univ. Nottingham, Nottingham, GBR) ,  SETCHFIELD Kerry (Univ. Nottingham, Nottingham, GBR) ,  BROOK J David (Univ. Nottingham, Nottingham, GBR) ,  BRECKPOT Jeroen (Univ. Hospitals Leuven, Leuven, BEL) ,  DEVRIENDT Koenraad (Univ. Hospitals Leuven, Leuven, BEL) ,  TURKI Saeed H Al (King Abdulaziz Medical City, Riyadh, SAU) ,  TURKI Saeed H Al (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  THIENPONT Bernard (VIB, Leuven, BEL) ,  THIENPONT Bernard (KU Leuven, Leuven, BEL) ,  ABDUL-KHALIQ Hashim (Saarland Univ., Homburg, DEU) ,  ABDUL-KHALIQ Hashim (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  BAUER Ulrike M M (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  DAEHNERT Ingo (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  PICKARDT Thomas (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  STILLER Brigitte (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  TOKA Okan (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  KLAASSEN Sabine (German Center for Cardiovascular Res. (DZHK), Berlin, DEU) ,  BANKA Siddharth (Univ. Manchester, Manchester, GBR) ,  BANKA Siddharth (St Mary’s Hospital, Manchester, GBR) ,  METCALFE Kay (St Mary’s Hospital, Manchester, GBR) ,  BENTHAM Jamie (Yorkshire Heart Centre, Leeds, GBR) ,  BERGER Felix (Charite Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  BHATTACHARYA Shoumo (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  COSGROVE Catherine (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  WATKINS Hugh (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  BU’LOCK Frances (Glenfield Hospital, Leicester, GBR) ,  THORNBOROUGH Chris (Glenfield Hospital, Leicester, GBR) ,  CANHAM Natalie (London North West Healthcare NHS Trust, Harrow, GBR) ,  COX Helen (Birmingham Women’s Hospital, Birmingham, GBR) ,  WILLIAMS Denise (Birmingham Women’s Hospital, Birmingham, GBR) ,  DAEHNERT Ingo (Univ. Leipzig, Leipzig, DEU) ,  DANESH John (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  OUWEHAND Willem H (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  ROBERTS David J (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  MOORE Carmel (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SAMBROOK Jennifer (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  FRYER Alan (Liverpool Women’s NHS Foundation Trust, Liverpool, GBR) ,  GEWILLIG Marc (Univ. Hospitals Leuven, Leuven, BEL) ,  LOUW Jacoba J (Univ. Hospitals Leuven, Leuven, BEL) ,  HOBSON Emma (Chapel Allerton Hospital, Leeds, GBR) ,  HOMFRAY Tessa (Univ. London, London, GBR) ,  KAHLERT Anne-Karin (Carl Gustav Carus Fac. of Medicine, Dresden, DEU) ,  LACHLAN Katherine (Princess Anne Hospital, Southampton, GBR) ,  LACHLAN Katherine (Salisbury District Hospital, Salisbury, GBR) ,  LACHLAN Katherine (Univ. Southampton, Southampton, GBR) ,  LAMPE Anne Katrin (Western General Hospital, Edinburgh, GBR) ,  MANICKARA Ashok Kumar (Hospital for Sick Children, Ontario, CAN) ,  MANASE Dorin (Hospital for Sick Children, Ontario, CAN) ,  MITAL Seema (Hospital for Sick Children, Ontario, CAN) ,  MCCARTHY Karen P (Imperial Coll., GBR) ,  NEWBURY-ECOB Ruth (St Michael’s Hospital, Bristol, GBR) ,  OMER Seham Osman (King Abdulaziz Medical City, Ministry of National Guard-Health Affairs, Riyadh, SAU) ,  OUWEHAND Willem H (NHS Blood and Transplant, Cambridge, GBR) ,  PARK Soo-Mi (Cambridge Univ. Hospitals NHS Foundation Trust, Cambridge, GBR) ,  PARKER Michael J (Western Bank, Sheffield, GBR) ,  ROBERT Leema (Guy’s Hospital, London, GBR) ,  ROBERTS David J (John Radcliffe Hospital, Oxford, GBR) ,  ROBERTS David J (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  STILLER Brigitte (Univ. Freiburg, Freiburg, DEU) ,  TOKA Okan (Friedrich Alexander Univ. Erlangen-Nuernberg (FAU), Erlangen, DEU) ,  WRIGHT Michael (Inst. of Human Genetics, Newcastle-upon-Tyne, GBR) ,  DAUBENEY Piers E F (Royal Brompton Hospital, London, GBR) ,  DAUBENEY Piers E F (Imperial Coll., GBR) ,  KEAVNEY Bernard (Univ. Manchester, Manchester, GBR) ,  GOODSHIP Judith (Newcastle Univ., Newcastle-upon-Tyne, GBR) ,  ABU-SULAIMAN Riyadh Mahdi (King Abdulaziz Medical City, Ministry of National Guard-Health Affairs, Riyadh, SAU) ,  ABU-SULAIMAN Riyadh Mahdi (King Saud bin Abdulaziz Univ. for Health Sci., Riyadh, SAU) ,  ABU-SULAIMAN Riyadh Mahdi (King Abdullah International Medical Res. Center (KAIMRC), Riyadh, SAU) ,  KLAASSEN Sabine (Charite Medical Fac. and Max Delbruck Center for Molecular Medicine, Berlin, DEU) ,  KLAASSEN Sabine (Charite Univ. Medicine, Berlin, DEU) ,  FIRTH Helen V (Cambridge Univ. Hospitals NHS Foundation Trust, Cambridge, GBR) ,  FITZPATRICK David R (Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 48  号： 9  ページ： 1060-1065  発行年： 2016年09月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 先天性心疾患(CHD)の新生児における発生率は0.8~1%である。ヒトおよびマウスにおいて単一遺伝子疾患としてのCHD症例が豊富に見られるにもかかわらず,同胞におけるCHDの絶対的再発リスクは低いことから(約2.7%),de novo変異(DNM)や不完全浸透の果たす役割が大きいと考えられる。de novoのタンパク質短縮型バリアント(PTV)は,心外性兆候が見られる「症候性」患者の10%に豊富に見られることが示されている。本論文では,症候性CHD(S-CHD,n=610)と非症候性CHD(NS-CHD,n=1,281)の両方を含む,1,891人の発端者のエキソーム塩基配列を決定した。S-CHDでは,既知のCHD関連遺伝子のde novo PTVが有意に豊富に存在したが,遺伝性PTVはあまり見られないことが確認され,これは最近の知見と一致していた。逆に,NS-CHDでは,非罹患の両親から受け継いだCHD関連遺伝子のPTVが有意に豊富に観察された。我々は,CHD4,CDK13,PRKD1のde novo変異によって引き起こされるゲノムワイドな有意水準に達する3つのS-CHD疾患を明らかにした。我々の研究は,S-CHDおよびNS-CHDに見られる低い同胞再発リスクを導く基盤として,両者間で異なる遺伝学的構造が存在する証拠を明らかにした。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： *先天性心疾患 ,  ゲノム ,  突然変異体 ,  タンパク質 ,  *遺伝子座 ,  *リスク
準シソーラス用語： CDK13 ,  CHD4 ,  *de novo変異 ,  PRKD1 ,  エクソーム ,  *タンパク質短縮型バリアント ,  塩基配列決定 ,  *再発リスク ,  症候性先天性心疾患 ,  非症候性先天性心疾患

分類 (5件)： 疫学  (GB03000E) ,  循環系の疾患  (GJ03000C) ,  循環系の診断  (GJ02000V) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 心疾患 ,  エキソーム ,  塩基配列 ,  同定 ,  症候 ,  先天性心疾患 ,  遺伝学的構造