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J-GLOBAL ID：201602270064038945   整理番号：16A0900428

2株の2.1Dの新しい遺伝子亜型のブタコレラウイルスの全ゲノム配列解析及びその遺伝子サブタイプの分子特徴を【JST・京大機械翻訳】

Characterization and complete genome sequence of two classical swine fever viruses belonging to 2.1d new subgenotype

著者 (11件)： Feng Liping (College of Life Science, Yangtze University, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology) ,  Zhang Hongliang (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Peng Jinmei (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Chunxiao (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wang Qian (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Li Zhen (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wu Tong (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Weng Changjiang (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Cai Xuehui (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Tian Zhijun (State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Xiong Tao (College of Life Science, Yangtze University)
資料名： Zhongguo Yufang Shouyixuebao  (Zhongguo Yufang Shouyixuebao)
巻： 38  号： 1  ページ： 1-5  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3099A  ISSN： 1008-0589  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 新しい遺伝子亜型の2.1D研究の古典的ブタコレラウイルス(CSFV)ゲノム特徴のために,本研究ではGENBANKにより登録されたZJCSFV0801株の全ゲノム配列の6対のプライマーを設計して合成した。RT-PCR法により2014年山東省からの2株は2.1DサブタイプCSFV (SDSG1410とSDLS1410)全ゲノム塩基配列解読を行った分離は,2株のCSFVの全長はいずれも12 296 NTであった。全遺伝子組遺伝演化解析をこの2つの分離株は1つの独立分岐中に位置し,2.1Dサブタイプに属し,E2遺伝子タイピング結果と一致を示した。ヌクレオチドとアミノ酸の相同性分析を導出し,分離株の遺伝子相同率は株と比べて差が大きく,ZJ0801株のゲノムの相同性は97.3%~97.5%であり,最も高かった。と%を示した。しかし,1.1サブタイプのSHIMENおよびHCLV株との相同性はわずか,85.0%~85.1%と84.3%~84.4%であった;部分遺伝子と非翻訳領域の変異が比較的に大きく,例えば(PRO)N C、E2、NS2、NS5Aと3’UTR。全遺伝子群のアミノ酸配列分析に対しては,結果は2.1DCSFVはV(640)、K(992)、A(1020)、M(1090)、R(1395)とD(2374)6か所のアミノ酸に共通の分子特性を持つサブタイプを示した。以上の研究結果は,CSFV 2.1D)新しい遺伝子亜型の分類根拠は増加した。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RT-PCR法 ,  *遺伝子 ,  *遺伝 ,  アミノ酸 ,  アミノ酸配列 ,  *ゲノム ,  相同性 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： 遺伝子クラスタ ,  非翻訳領域 ,  遺伝子タイピング ,  分離株 ,  *サブタイプ ,  *ゲノム配列 ,  *ブタコレラウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： classical swine fever virus ,  2.1d new subgenotype ,  genome characteristics

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (10件)： 株 ,  1D ,  遺伝子 ,  亜型 ,  ブタコレラウイルス ,  ゲノム ,  配列解析 ,  サブ ,  タイプ ,  分子