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J-GLOBAL ID：201602275690315241   整理番号：16A0879742

アミノ酸残基と蛋白質表面ポケット間の幾何学的距離に基づく薬物可能性解析と予測【Powered by NICT】

Druggability Analysis and Prediction Based on Geometric Distances between Amino Acid Residues and Protein Surface Pockets

著者 (5件)： Miyoshi Makiko ,  Kaneko Ayaka ,  Itoh Takayuki ,  Yura Kei ,  Takatsuka Masahiro
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： NicoInt  ページ： 21-24  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質は生物の主要成分である。蛋白質表面への凹形(ポケット)を反応への薬物のthebest標的であることが知られている。以前にポケットとアミノacidresidue間の距離解析にastudyを示した。蛋白質surfaceandアミノacidresidueと最も深い点の原子またはポケットの外側ループ間の距離を計算にポケットを同定した。アミノ酸残基の任意対にarecloseポケットの少なくとも一つ,新薬の開発につながる蛋白質のtheratiosを計算し,着色マトリックスとして比をdistributionofを可視化する蛋白質を抽出した。アミノ酸residuesmayの特別な対はpreviousstudyにおける蛋白質のドラッガビリティに影響するthevisualization結果から示唆された。蛋白質のドラッガビリティのexplorethe関連性本研究の拡張を提示し,アミノ酸残基と蛋白質surfacepocketsのセットをdistancesbetween。この方法はアミノ酸残基の各々までの距離からなる,20dimensionalvectorsとしてポケットを扱い,ベクトル集合とGeodesicSOMを適用した。GeodesicSOMにより生成されたSphericalmapsは次元vectorspaceにおけるポケットの分布,およびポケットの次元ベクトルを用いた蛋白質のドラッガビリティの推定をvisualizationofに使用されている。Copyright 2016 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： ベクトル ,  新薬 ,  *アミノ酸残基 ,  着色 ,  *タンパク質 ,  可視化 ,  凹形

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  パターン認識  (JE07000S)

タイトルに関連する用語 (7件)： アミノ酸残基 ,  蛋白質 ,  幾何学 ,  薬物 ,  可能性 ,  解析 ,  予測