ダイズMPBQ-MT遺伝子のクローン化とバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Nie Tengkun; Zhao Lin; Li Haiyan; Li Wenbin

文献

J-GLOBAL ID：201602289704149200 整理番号：16A0819808

ダイズMPBQ-MT遺伝子のクローン化とバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Bioinformatics Analysis of MPBQ-MT Gene in Soybean

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資料名：
巻： 35 号： 1 ページ： 39-45 発行年： 2016年
JST資料番号： C2212A ISSN： 1000-9841 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

ダイズ品種HEFENG25とBAYFIELDを材料として,ダイズをクローン化し2-メチル-6-フィチル-1,4-ベンゾキノンメチル転移酵素(MPBQMTASE)遺伝子,1 029 BPのMPBQ-MT遺伝子CDNA配列を得た。配列アラインメントにより,10個のダイズMPBQ-MT遺伝子CDNA領域内の潜在的SNP部位を見出した。MPBQ-MT遺伝子コードのアミノ酸配列と蛋白質構造を,バイオインフォマティクス法を採用することによって分析した。結果:MPBQ-MT遺伝子CDS区共342個のアミノ酸残基をコードしているが,その中のバリン(VAL)含有量が最も多く,この遺伝子によってコード化されたアミノ酸の総数の8.8%を占めた;システイン(CYS)含有量が最も少なく,この遺伝子によってコード化されたアミノ酸の総数の1.2%を占めた;MPBQ-MT蛋白質のN末端は58個のアミノ酸からなる葉緑体輸送ペプチドを含み,親水性蛋白質であった。HEFENG25とBAYFIELDのMPBQ-MT蛋白質の二次構造は異なり,2つの品種からのMTMPBQ-蛋白質中のΑヘリックスはそれぞれ25.44%と27.49%を占め,Β-ターンはそれぞれ9.36%と9.06%を占めた。無規則コイルそれぞれ40.35%と38.60%を占める。2つの品種からのMTMPBQ-蛋白質中のラメラ構造はすべて24.85%を占める。2つの品種からのMTMPBQ-蛋白質ではいずれも1つのS-アデノシルメチオニン結合部位があった。MTMPBQ-蛋白質の3次構造に対して予測を行い,輸送ペプチドを除去した後,MPBQ-MT蛋白質の3次構造は主として連続したラメラ構造の連続した11個のΑ-ヘリックス領域と8つの領域から成る発見。MTMPBQ-結合タンパク質の3次構造はMPBQ-MT遺伝子の生物学的機能をさらに分析し,比較的合理的のMPBQ-MT相互作用のモデルを提案した。システムから発生するツリーMPBQ-MT蛋白質ダイズとインゲンマメにおける遺伝的類縁関係が近いことがわかった。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

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酵素一般 , 遺伝子の構造と化学

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