特許
J-GLOBAL ID：201603008966213630
HLA遺伝子のDNAタイピング方法及び当該方法のデータ解析に使用するコンピュータプログラム
発明者：
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出願人/特許権者：
代理人 (1件)：
内田 直人
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2014-116217
公開番号（公開出願番号）：特開2015-228819
出願日： 2014年06月04日
公開日（公表日）： 2015年12月21日
要約：
【課題】 超並列高速シークエンサーから得られるリード配列から迅速かつ高精度にHLAアリルを判定することのできるHLA遺伝子タイピング方法を提供する。【解決手段】 超並列高速シークエンサーから出力されるリード配列とHLAアリルの塩基配列データベースの塩基配列との類似性解析を各座位(ローカス)のエクソン毎に実施し、各エクソンについて一致するあるいは高い類似性を示すHLAアリルを抽出し、次いで当該座位の全エクソンに共通して一致するあるいは高い類似性を示すHLAアリルを抽出してマッピングのための候補アリルとする工程、候補アリルの塩基配列をリファレンス配列としてリード配列をマッピングする工程を含む、HLA遺伝子のDNAタイピング方法、及び当該方法のデータ解析に使用するコンピュータプログラム。【選択図】 図2
請求項（抜粋）：
超並列高速シークエンサーから出力されるリード配列とHLAアリルの塩基配列データベースとの類似性解析を各座位(ローカス)のエクソン毎に実施し、各エクソンについて一致するあるいは高い類似性を示すアリルを記録し、次いで当該座位の全エクソンに共通して高い類似性を示すHLAアリルを抽出して、これをマッピングのための候補アリルとする工程を含む、HLA遺伝子のDNAタイピング方法。
IPC (2件)：
FI (2件)：
Fターム (13件)：
4B024AA11
, 4B024CA01
, 4B024CA11
, 4B024HA11
, 4B063QA01
, 4B063QA13
, 4B063QA20
, 4B063QQ42
, 4B063QQ52
, 4B063QR32
, 4B063QR35
, 4B063QS31
, 4B063QS39
