資源
J-GLOBAL ID:201610017567647119   研究資源コード:NBDC01562 更新日:2017年11月27日

TOMATOMICS

TOMATOMICS
保有機関:
  • 明治大学 農学部
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (3件): ゲノム/遺伝子 ,  cDNA/EST ,  遺伝的多様性
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  発現
生物種 (1件): Solanum lycopersicum (NCBI Taxonomy ID: 4081)
概要:
トマトの統合オミックスデータベースです。全てのトマトのEST配列、マイクロトムの完全長cDNA配列、ITAG2.4遺伝子モデルの配列を収録しています。各配列は予測されたゲノム上の位置に基づいてクラスター化され、対応づけられており、InterProやKEGG PathwayなどのデータベースへのBLAST結果に基づいてアノテーションされています。ゲノムブラウザーである「JBrowse」では、ゲノム構造アノテーション、Heinz 1906とMicro-TomのSNP、RNA-seqの情報などをみることができます。遺伝子発現や共発現の情報もITAG gene modelについて示されています。遺伝子名、ゲノムブラウザーでの検索やBLASTによる検索が可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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