資源
J-GLOBAL ID:201610017567647119
研究資源コード:NBDC01562
更新日:2017年11月27日
TOMATOMICS
TOMATOMICS
保有機関:
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (3件):
ゲノム/遺伝子
, cDNA/EST
, 遺伝的多様性
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 発現
生物種 (1件):
Solanum lycopersicum (NCBI Taxonomy ID: 4081)
概要:
トマトの統合オミックスデータベースです。全てのトマトのEST配列、マイクロトムの完全長cDNA配列、ITAG2.4遺伝子モデルの配列を収録しています。各配列は予測されたゲノム上の位置に基づいてクラスター化され、対応づけられており、InterProやKEGG PathwayなどのデータベースへのBLAST結果に基づいてアノテーションされています。ゲノムブラウザーである「JBrowse」では、ゲノム構造アノテーション、Heinz 1906とMicro-TomのSNP、RNA-seqの情報などをみることができます。遺伝子発現や共発現の情報もITAG gene modelについて示されています。遺伝子名、ゲノムブラウザーでの検索やBLASTによる検索が可能です。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
前のページに戻る