国田勝行

KUNIDA Katsuyuki

所属機関・部署：
職名：准教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

藤田医科大学精神・神経病態解明センター計算科学部門准教授

ホームページURL (1件)： https://sites.google.com/view/kkunidalab

研究分野 (4件)：生命、健康、医療情報学 , 細胞生物学 , システムゲノム科学 , 医化学

研究キーワード (24件)：モデル予測制御 , 流加培養 , 抗体産生 , SVM分類 , サイトカイン , 心筋炎 , モデル選択規準 , 逆相関解析 , 階層化制御 , 人工遺伝子回路 , 微生物バイオプロセス , スパースモデリング , 時系列モデリング , 細胞運命決定 , 画像認識アルゴリズム , 骨格筋 , 遺伝子発現 , 代謝変動 , インスリンシグナル , Rho GTPase シグナル , 生細胞イメージング , 細胞運動 , 生化学反応モデリング , MAPKシグナル

競争的資金等の研究課題 (6件)：

2024 - 2025 癌細胞における細胞極性関連因子RhoGEF の機能解析
2019 - 2023 協調的な分子情報と力で駆動する細胞運動プロセスのデータ同化予測
2019 - 2021 計測・解析・制御が融合したデータ駆動型細胞制御システムの開発
2019 - 2020 細胞システムの最適制御アルゴリズム創出に向けた課題調査
2016 - 2019 骨格筋におけるインスリンシグナル伝達経路の選択的制御機構の解明

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論文 (34件)：

Tomoki Ohkubo, Yuichi Sakumura, Fuzhong Zhang, Katsuyuki Kunida. A hybrid in silico/in-cell controller that handles process-model mismatches using intracellular biosensing. Scientific Reports. 2024. 14. 27252
国田勝行, 作村諭一. 細胞の変形動態を複数のRho GTPase活性の統合から解読する. 生物物理. 2024. 64. 5
Yoji Nomura, Takanori Suzuki, Katsuyuki Kunida, Hidetoshi Uchida, Ryoichi Ito, Yasunori Oshima, Machiko Kito, Yuki Imai, Satoru Kawai, Kei Kozawa, et al. Analysis of cytokine profiles in pediatric fulminant myocarditis and acute myocarditis multicenter study. Pediatric Cardiology. 2024
Tomoki Ohkubo, Yuichi Sakumura, Katsuyuki Kunida. On-Line Reoptimization of Mammalian Fed-Batch Culture Using a Nonlinear Model Predictive Controller. New Generation Computing. 2023. 42. 283-302
Yuichi Sakumura, Katsuyuki Kunida. Extracting quantitative relationships between cell motility and molecular activities: analytical approaches and implications. Journal of Biomechanical Science and Engineering. 2023. 18. 4. 23-00336

MISC (2件)：

Chen Xing, Yuichi Sakumura, Toshiya Kokaji, Katsuyuki Kunida, Noriaki Sasai. Stepwise Bayesian Machine Learning Uncovers a Novel Gene Regulatory Network Component in Neural Tube Development. bioRxiv. 2024
Tomoki Ohkubo, Haruyuki Kinoshita, Toshiro Maekawa, Katsuyuki Kunida, Hiroshi Kimura, Shinya Kuroda, Teruo Fujii. Development of a microfluidic cell culture and monitoring system for intracellular signaling studies. bioRxiv. 2018

特許 (1件)：

時系列画像を用いた多核で細長い細胞の自動的細胞認識法

講演・口頭発表等 (43件)：

薬物治療下における脳全体の神経細胞活性化マップデータのネットワーク結合解析
(NEURO2024 2024)
代謝力学系モデルを用いた振動応答の最適制御
(情報処理学会第148回数理モデル化と問題解決 (MPS) 研究会 2024)
微生物とコンピュータの協調制御
(制御理論と生物学の境界 2024)
Model selection algorithm for metabolite-enzyme networks including allosteric feedback
(EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg))
Integrated analysis for identifying the network controllability of intracellular molecular signaling
(EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg))

学位 (1件)：

博士(医学) (京都大学)

経歴 (14件)：

2024/04 - 現在藤田医科大学精神・神経病態解明センター計算科学部門(兼) 准教授
2024/04 - 現在藤田医科大学医学部情報生命科学准教授
2021/04 - 現在奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス領域客員准教授
2021/04 - 2024/03 藤田医科大学精神・神経病態解明センター計算科学部門(兼) 講師
2021/04 - 2024/03 藤田医科大学医学部情報生命科学講師

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委員歴 (6件)：

2024 - 現在日本細胞生物学会代議員
2024 - 現在情報処理学会数理モデル化と問題解決(MPS)研究会運営委員
2021 - 現在藤田医大医学部指導教員
2021 - 現在藤田医大医学部広報委員会委員
2017 - 現在 Faculty of 1000 Associate Faculty Member

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受賞 (2件)：

2019/11 - Asia-Pacific Signal and Information Processing Association Annual Summit and Conference (APSIPA ASC) 2019 Best Special Session Paper Award
2009/10 - 第82回日本生化学会大会一般口答発表優秀プレゼンテーション賞

所属学会 (5件)：

定量生物学の会 , 日本分子生物学会 , 日本細胞生物学会 , 日本生物物理学会 , 情報処理学会

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