研究者
J-GLOBAL ID：201701010671243834   更新日: 2024年07月06日

菅原 武志

スガワラ タケシ | SUGAWARA Takeshi
所属機関・部署：
高知大学 データサイエンスセンター

高知大学 データサイエンスセンター について


研究分野 (3件)： 生命、健康、医療情報学 ,  生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 ,  生物物理学
競争的資金等の研究課題 (6件)：
  • 2024 - 2025 数理・データ・AI駆動の学内DXマルチモーダル推進
  • 2023 - 2024 拡散モデルによる3Dゲノム動態予測
  • 2023 - 2024 数理データサイエンスに根ざした異分野融合型研究教育基盤の構築
  • 2017 - 2023 ゲノム構造大域的遷移の数理的解明
  • 2016 - 2018 核内クロマチン構造のフラクタル次元と核内温度の同時イメージング技術の開発
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論文 (15件)：
  • Takeshi Sugawara, Kunihiko Kaneko. Chemophoresis engine: A general mechanism of ATPase-driven cargo transport. PLoS computational biology. 2022. 18. 7. e1010324
  • Soya Shinkai, Masaki Nakagawa, Takeshi Sugawara, Yuichi Togashi, Hiroshi Ochiai, Ryuichiro Nakato, Yuichi Taniguchi, Shuichi Onami. PHi-C: deciphering Hi-C data into polymer dynamics. NAR genomics and bioinformatics. 2020. 2. 2. lqaa020
  • Soya Shinkai, Takeshi Sugawara, Hisashi Miura, Ichiro Hiratani, Shuichi Onami. Microrheology for Hi-C Data Reveals the Spectrum of the Dynamic 3D Genome Organization. Biophysical journal. 2020. 118. 9. 2220-2228
  • Hiroaki Ito, Takeshi Sugawara, Soya Shinkai, Satoshi Mizukawa, Ayaka Kondo, Hisamichi Senda, Kengo Sawai, Koki Ito, Sayaka Suzuki, Masakatsu Takaine, et al. Spindle pole body movement is affected by glucose and ammonium chloride in fission yeast. Biochemical and biophysical research communications. 2019. 511. 4. 820-825
  • Ritsuko Arai, Takeshi Sugawara, Yuko Sato, Yohei Minakuchi, Atsushi Toyoda, Kentaro Nabeshima, Hiroshi Kimura, Akatsuki Kimura. Reduction in chromosome mobility accompanies nuclear organization during early embryogenesis in Caenorhabditis elegans. Scientific reports. 2017. 7. 1. 3631-3631
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MISC (7件)：
  • 菅原 武志, 升田 賢太, 上脇 隼一, 粟津 暁紀, 西森 拓, 上野 勝. 10aAR-6 細胞核内クロマチンダイナミクスの定量的解析(10aAR 領域12,領域11合同 生物合同II,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理)). 日本物理学会講演概要集. 2014. 69.2.2. 227
  • 菅原 武志, 粟津 暁紀, 西森 拓. 8pPSB-56 クロマチン高次構造のtoy model(8pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理)). 日本物理学会講演概要集. 2014. 69.2.2. 217
  • 菅原 武志, 粟津 暁紀, 西森 拓. 26aKL-8 染色体の空間構造の機能的役割について(生物合同2,領域11,領域12合同,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)). 日本物理学会講演概要集. 2013. 68.2.2. 241
  • 菅原 武志. 1SD-04 線虫初期胚における染色体ダイナミクスの定量的解析(1SD 核内分子動態から観る遺伝子発現機構,シンポジウム,日本生物物理学会第50回年会(2012年度)). 生物物理. 2012. 52. supplement. S4-S5
  • 菅原 武志, 金子 邦彦. 20aED-4 「ケモフォレシス」によって駆動されるプラスミドダイナミクス(20aED 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理)). 日本物理学会講演概要集. 2010. 65.1.2. 361
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講演・口頭発表等 (26件)：
  • 生成モデルを用いた3Dゲノム動態予測
    (日本物理学会2024年春季大会 2024)
  • 液滴-遺伝子相互作用の現象論モデル
    (日本物理学会2024年春季大会 2024)
  • 液滴誘導型細胞内走化性の理論
    (第61日本生物物理学会年会 2023)
  • べん毛モーター時系列データ解析とエントロピー生成率(EPR)推定
    (第7回新学術領域会議 2023)
  • べん毛モーター回転時系列データからのエントロピー生成率推定
    (第6回新学術領域会議 2023)
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学位 (1件)：
  • 博士(学術) (東京大学)
経歴 (8件)：
  • 2023/04 - 現在 東京大学 大学院理学系研究科附属 生物普遍性研究機構 客員研究員
  • 2023/04 - 現在 高知大学 データサイエンスセンター 特任講師
  • 2021/04 - 2023/03 東京大学 大学院理学系研究科附属生物普遍性研究機構 特任研究員
  • 2018/04 - 2021/03 東京大学 大学院医学系研究科分子生物学分野 特任助教
  • 2017/08 - 2021/03 理化学研究所 生命機能科学研究センター 客員研究員
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