森義治

モリヨシハル | Mori Yoshiharu

所属機関・部署：
職名：特任准教授
ホームページURL (1件)： https://quantum.keio.ac.jp/

研究分野 (3件)：生命、健康、医療情報学 , 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 , 生物物理学

研究キーワード (5件)：量子コンピューティング , バイオインフォマティクス , タンパク質 , 分子シミュレーション , 生物物理

競争的資金等の研究課題 (4件)：

論文 (25件)：

Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Stabilization mechanism of initiator transfer RNA in the small ribosomal subunit from coarse-grained molecular simulations. Journal of Physical Chemistry B. 2024
Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Navigating ultralarge virtual chemical spaces with product-of-experts chemical language models. Journal of Chemical Information and Modeling. 2024. 64. 7873-7884
Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Anesthetic binding induced motion of GABA_A receptors revealed by coarse-grained molecular dynamics simulations. Journal of Physical Chemistry B. 2023. 127. 6306-6315
Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. End-to-end protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models. BMC Bioinformatics. 2023. 24. 233
Ikuo Kurisaki, Seiya Tanaka, Ichiro Mori, Toshihito Umegaki, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Thermal conductivity and conductance of protein in aqueous solution: Effects of geometrical shape. Journal of Computational Chemistry. 2023. 44. 857-868

MISC (9件)：

森義治. リボソーム小サブユニットにおける開始tRNA安定化の分子機構. アンサンブル. 2024. 26. 269-275
Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Stabilization mechanism of initiator transfer RNA in the small ribosomal subunit from coarse-grained molecular simulations. bioRxiv. 2024
Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Navigating ultra-large virtual chemical spaces with product-of-experts chemical language models. ChemRxiv. 2024
Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Anesthetic-binding induced motion of GABA A receptors revealed by coarse-grained molecular dynamics simulations. bioRxiv. 2023
Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. End-to-end protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models. bioRxiv. 2022

書籍 (3件)：

Enhanced sampling algorithms
Biomolecular Simulations: Methods and Protocols, Humana Press, 153-195 2013
Generalized isobaric-isothermal ensemble algorithms
From Computational Biophysics to Systems Biology, John von Neumann Institute for Computing, 139-144 2012
Generalized-ensemble simulations in protein science
Proceedings of the 4th Japan-Russia International Workshop MSSMBS'10, Nova Science, 46-60 2011

講演・口頭発表等 (142件)：

FMO計算と構造揺らぎから明らかにする生体分子の構造と機能
(FMO研究セミナー -これまでとこれから- 2025)
量子アルゴリズムを利用したタンパク質フォールディングモデルのモンテカルロシミュレーション
(第38回分子シミュレーション討論会 2024)
量子計算を活用した効率的モンテカルロシミュレーション実行とその化学への応用に向けて
(第68回Q-LEAP量子AIセミナー 2024)
Comprehensive docking simulations using AlphaFold2-based human olfactory receptors for odor prediction
(CBI学会2024年大会 2024)
量子化学計算に基づくIL-10と受容体のPPIにおけるホットスポット定量的予測
(第74回日本薬学会関西支部大会 2024)

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (7件)：

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受賞 (3件)：

所属学会 (11件)：

日本薬学会 , 情報計算化学生物学会 , 日本分子生物学会 , 分子科学会 , 分子シミュレーション学会 , 日本蛋白質科学会 , 日本生物物理学会 , 情報処理学会 , 量子生命科学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 日本物理学会

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森 義治