研究者
J-GLOBAL ID:201701011471488391   更新日: 2024年02月16日

森 義治

モリ ヨシハル | Mori Yoshiharu
所属機関・部署:
職名: 特任准教授
ホームページURL (1件): https://quantum.keio.ac.jp/
研究分野 (3件): 生命、健康、医療情報学 ,  生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 ,  生物物理学
研究キーワード (4件): バイオインフォマティクス ,  タンパク質 ,  分子シミュレーション ,  生物物理
競争的資金等の研究課題 (4件):
  • 2021 - 2024 翻訳過程における高精度タンパク質合成の分子機構の解明
  • 2019 - 2020 マルチスケール分子シミュレーションによる受容体チロシンキナーゼの構造モデリング
  • 2016 - 2019 タンパク質合成におけるアミノ酸の高精度選択機構の解明
  • 2011 - 2013 ATP合成におけるタンパク質触媒機構の理論的研究
論文 (23件):
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MISC (6件):
  • Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Anesthetic-binding induced motion of GABA A receptors revealed by coarse-grained molecular dynamics simulations. bioRxiv. 2023
  • Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. End-to-end protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models. bioRxiv. 2022
  • 森 義治. マルチスケール分子シミュレーションによる受容体チロシンキナーゼの構造モデリング. 東京大学情報基盤センター スーパーコンピューティングニュース. 2022. 24. 74-78
  • Ayori Mitsutake, Yoshiharu Mori, Yuko Okamoto. Enhanced sampling algorithms. arXiv. 2010
  • Yoshiharu Mori, Yuko Okamoto. Generalized-ensemble algorithms for the isobaric-isothermal ensemble. arXiv. 2010
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書籍 (3件):
  • Enhanced sampling algorithms
    Biomolecular Simulations: Methods and Protocols, Humana Press, 153-195 2013
  • Generalized isobaric-isothermal ensemble algorithms
    From Computational Biophysics to Systems Biology, John von Neumann Institute for Computing, 139-144 2012
  • Generalized-ensemble simulations in protein science
    Proceedings of the 4th Japan-Russia International Workshop MSSMBS'10, Nova Science, 46-60 2011
講演・口頭発表等 (126件):
  • インフルエンザウイルスのヘマグルチニンとFab抗体の複合体(PDB-ID: 1KEN)に関するMM-MD/FMO連携計算による統計的な解析#3
    (第71回応用物理学会春季学術講演会 2024)
  • Efficient exploration of combinatorial chemical spaces with composite SMILES language models
    (第46回ケモインフォマティクス討論会 2023)
  • Interaction analysis of IL-10 receptor complex using MD and FMO calculations
    (CBI学会2023年大会 2023)
  • Composing property-specific SMILES language models for multi-objective drug-like molecule generation
    (CBI学会2023年大会 2023)
  • 翻訳開始過程における開始tRNA認識の分子機構:tRNAとリボソームタンパク質の進化を探る
    (CBI学会2023年大会 2023)
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学歴 (3件):
  • 2009 - 2011 名古屋大学大学院 理学研究科 物質理学専攻(物理系) 博士課程(後期課程)
  • 2007 - 2009 名古屋大学大学院 理学研究科 物質理学専攻(物理系) 博士課程(前期課程)
  • 2003 - 2007 名古屋大学 理学部 物理学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (名古屋大学)
経歴 (7件):
  • 2023/10 - 現在 慶應義塾大学 理工学研究科 特任准教授
  • 2023/10 - 現在 神戸大学 大学院システム情報学研究科 客員准教授
  • 2020/04 - 2023/09 神戸大学 大学院システム情報学研究科 講師
  • 2017/04 - 2020/03 北里大学 薬学部 助教
  • 2012/05 - 2017/03 分子科学研究所 理論・計算分子科学研究領域 特任助教
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受賞 (3件):
  • 2021/10 - CBI学会2021年大会 口頭発表賞
  • 2011/03 - 名古屋大学 学術奨励賞
  • 2009/12 - 第23回分子シミュレーション討論会 学生優秀発表賞 「レプリカ交換分子動力学法における適切なスケーリング法」
所属学会 (10件):
日本薬学会 ,  情報計算化学生物学会 ,  日本分子生物学会 ,  分子科学会 ,  分子シミュレーション学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本生物物理学会 ,  量子生命科学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本物理学会
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