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J-GLOBAL ID：201702210228445462   整理番号：17A1194824

ヤクシマランのゲノムとランの進化

The Apostasia genome and the evolution of orchids

著者 (48件)： ZHANG Guo-Qiang (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIU Ke-Wei (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  NIU Shan-Ce (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WANG Jie-Yu (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  XU Qing (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  CHEN Li-Jun (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  ZHANG Yong-Qiang (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WANG Meina (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIU Guo-Hui (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  PECORARO Lorenzo (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  HUANG Hui-Xia (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  XIAO Xin-Ju (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIN Min (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WU Xin-Yi (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WU Wan-Lin (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  ZENG Si-Jin (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIU Zhong-Jian (National Orchid Conservation Center of China and Orchid Conservation and Res. Center of Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LI Zhen (Ghent Univ., Gent, BEL) ,  LOHAUS Rolf (Ghent Univ., Gent, BEL) ,  LIN Yao-Cheng (Ghent Univ., Gent, BEL) ,  VAN DE PEER Yves (Ghent Univ., Gent, BEL) ,  LI Zhen (VIB Center for Plant Systems Biology, Gent, BEL) ,  LOHAUS Rolf (VIB Center for Plant Systems Biology, Gent, BEL) ,  LIN Yao-Cheng (VIB Center for Plant Systems Biology, Gent, BEL) ,  VAN DE PEER Yves (VIB Center for Plant Systems Biology, Gent, BEL) ,  HSIAO Yu-Yun (National Cheng Kung Univ., Tainan, TWN) ,  WU Wan-Lin (National Cheng Kung Univ., Tainan, TWN) ,  CHEN You-Yi (National Cheng Kung Univ., Tainan, TWN) ,  CHANG Song-Bin (National Cheng Kung Univ., Tainan, TWN) ,  TSAI Wen-Chieh (National Cheng Kung Univ., Tainan, TWN) ,  NIU Shan-Ce (Inst. of Botany, Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN) ,  LUO Yi-Bo (Inst. of Botany, Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN) ,  WANG Jie-Yu (South China Agricultural Univ., Guangzhou, CHN) ,  ZENG Si-Jin (South China Agricultural Univ., Guangzhou, CHN) ,  LIU Zhong-Jian (South China Agricultural Univ., Guangzhou, CHN) ,  YOSHIDA Kouki (Taisei Corp., Kanagawa, JPN) ,  FUJIWARA Sumire (National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol. (AIST), Ibaraki, JPN) ,  MITSUDA Nobutaka (National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol. (AIST), Ibaraki, JPN) ,  SAKAMOTO Shingo (National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol. (AIST), Ibaraki, JPN) ,  OHME-TAKAGI Masaru (National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol. (AIST), Ibaraki, JPN) ,  WANG Zhi-Wen (PubBio-Tech Serv. Corp., Wuhan, CHN) ,  OHME-TAKAGI Masaru (Saitama Univ., Saitama, JPN) ,  YEH Chuan-Ming (Saitama Univ., Saitama, JPN) ,  YAGI Masafumi (NARO Inst. of Floricultural Sci. (NIFS), Ibaraki, JPN) ,  SHEN Ching-Yu (National Cheng Kung Univ., Tainan, TWN) ,  VAN DE PEER Yves (Genomics Res. Inst., Pretoria, ZAF) ,  LIU Zhong-Jian (Fujian Agriculture and Forestry Univ., Fuzhou, CHN) ,  LIU Zhong-Jian (Tsinghua Univ., Shenzhen, CHN)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 549  号： 7672  ページ： 379-383  発行年： 2017年09月21日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 顕花植物のおよそ10%を占めるラン科(Orchidaceae)の植物は,独特な形態の花をつけ,極めて多彩な生活様式を有し,地球上のほとんど全ての生息環境にうまく定着してきた。本論文では,ラン科の姉妹系統群の1つ,ヤクシマラン亜科(Apostasioideae)を構成する2つの属の一方であるヤクシマラン属のApostasia shenzhenicaの概要ゲノム塩基配列を報告する。この解析は,全ての現生ラン科植物の最も近い共通祖先のゲノムの量や構造を推測する手掛かりとなり,それらの起源と進化についての理解を深める助けになる。加えて,バニラ亜科(Vanilloideae),アツモリソウ亜科(Cypripedioideae),およびチドリソウ亜科(Orchidoideae)の各代表種についてのトランスクリプトームのデータと,セッコク亜科(Epidendroideae)の2種についての第3世代シーケンサーで決定した新たなゲノムデータを提示することで,ラン科の5つの亜科全てを網羅する。A.shenzhenicaには,全ゲノム重複が起こったことを示す明らかな証拠が見られ,この全ゲノム重複は全てのランに共通しており,分岐の直前に起きたことが分かった。A.shenzhenicaと他のランや被子植物との比較から,祖先的なランの遺伝子ツールキットの再現が可能になった。さらに,新しい遺伝子ファミリーが見つかり,ランの進化の過程で起こった遺伝子ファミリーの拡大や縮小,多種多様な発生過程を制御する複数のMADSボックス遺伝子クラス内での変化が明らかになった。我々の研究は,着生の進化のみならず,唇弁やずい柱の発生,花粉塊,胚乳を持たない種子などといった,ラン科植物の主要な革新の基盤となる遺伝的機構についても新たな洞察をもたらすとともに,ラン科の亜科間の関係を明らかにしており,また,被子植物内でのランの進化史の解明にも役立つ。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： *ラン科 ,  遺伝学 ,  *生物進化 ,  歴史 ,  *遺伝子重複 ,  *進化史 ,  *ゲノミクス ,  *単子葉植物 ,  自然科学 ,  *分子遺伝現象
準シソーラス用語： *Apostasia shenzhenica ,  *ゲノム解析 ,  ゲノム重複

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  植物分類学  (EH01030N)

タイトルに関連する用語 (2件)： ゲノム ,  進化