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J-GLOBAL ID：201702211222535295   整理番号：17A1389200

Klebsiella oxytocaに対するワクチン候補のin silico同定【Powered by NICT】

In silico identification of vaccine candidates against Klebsiella oxytoca

著者 (3件)： Talukdar Sandipan (Dept of Bioengineering & Technology, GUIST, Gauhati University, India) ,  Bayan Udeshna (Dept of Bioengineering & Technology, GUIST, Gauhati University, India) ,  Saikia Kandarpa Kr. (Dept of Bioengineering & Technology, GUIST, Gauhati University, India)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 69  ページ： 48-54  発行年： 2017年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Klebsiella oxytocaは免疫不全と同様に健常人におけるいくつかの疾患を引き起こす。数抗生物質に対する耐性の増加は治療選択肢は限られたにしている。Klebsiella oxytocaによる感染を得るための重要な解決策であるワクチンを用いた予防。最近では,ゲノムに基づくアプローチはワクチン開発に大きく寄与している。著者らの目的は,潜在的ワクチン候補として考えられることを最も保存され免疫原性抗原を同定することであった。KEGGデータベースは細菌へのユニークな経路を見出すために使用した。選択した三十六の経路から採取した蛋白質配列の細胞内局在性は,PSORTbν3 0.2とCELLO v2を用いて予測した。B細胞エピトープの予測と抗原性の確率はそれぞれIEDBとVaxijenを用いて評価した。BLASTpはヒトプロテオームと選択した蛋白質の類似性を見出すために行った。セットしたパラメーターに従わない蛋白質はそれぞれの段階で除いた。最後に,Klebsiella oxytocaに対する潜在的ワクチン候補としての6表面に露出した蛋白質を同定した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 類似性 ,  抗原 ,  免疫不全症候群 ,  タンパク質 ,  ゲノム ,  *Klebsiella ,  データベース ,  *ワクチン ,  抗生物質 ,  免疫原性
準シソーラス用語： B細胞エピトープ ,  細胞内局在 ,  ワクチン開発 ,  *in silico ,  *Klebsiella oxytoca , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Klebsiella oxytoca ,  ワクチン ,  逆ワクチン学 ,  B細胞エピトープ ,  外膜蛋白質

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (3件)： Klebsiella ,  ワクチン ,  同定