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J-GLOBAL ID：201702211566262233   整理番号：17A0109834

トランスクリプトーム配列決定により,Ya青殻の形質転換に関連する遺伝子をスクリーニングした。【JST・京大機械翻訳】

Identifying Genes Associated with Blue Eggshell in Ducks (Anas platyrhynchos domesticus) by Transcriptome Analysis

著者 (5件)： Chen Li (Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences) ,  Huang Xuetao (Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences) ,  Tian Yong (Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences) ,  Tao Zhengrong (Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences) ,  Lu Lizhi (Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Nongye Shengwu Jishu Xuebao  (Nongye Shengwu Jishu Xuebao)
巻： 24  号： 7  ページ： 1064-1072  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2715A  ISSN： 1674-7968  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ムール貝の性状はアヒル(ANAS PLATYRHYNCHOS DOMESTICUS)の重要な経済性状であるが、その遺伝機序はまだ発表されていない。Ya青殻の形質形成のトランスクリプトーム基礎を研究するため、本研究では、測交法により遺伝子型が純合青殻及びおよびの遺伝子型を選別し、2種類の遺伝子型の子宮組織に対してトランスクリプトームシークエンシングを行った。本研究では,288の高品質のデータを得て,64の新しい転写産物を含む64の転写を構築した。20の302回の可変剪断事象を同定し,その中で,エキソンは最も重要な可変せん断タイプであった。発現分析により、1の遺伝子は2つの遺伝子型の個体間で差次的に発現し、その中に卵殻の主要な色素物質(プロトポルフィリン、ビリベルジン及びそのキレート)と関連する遺伝子が含まれていることが分かった。例えば、ビリベルジン還元酵素A遺伝子(BILIVERDIN REDUCTASE A, BLVRA)、尿BuLin原 III遺伝子(UROPORPHYRINOGEN III SYNTHASE, UROS)、ヘモグロビンΑサブユニット遺伝子(HEMOGLOBIN SUBUNIT ALPHA-1, HBA1)及びヘム結合タンパク質1遺伝子(HEME BINDING PROTEIN 1, HEBP1)などである。差異遺伝子の遺伝子オントロジー(GENE ONTOLOGY, GO)アノテーション及び京都遺伝子とゲノムシソーラス(KYOTO ENCYCLOPEDIA OF GENES AND GENOMES, KEGG)経路分析により、これらの遺伝子は広範な生物機能及び経路に関与していることが明らかになった。その中で卵殻の色形成と密接に関連するヘム機能(例えば,ヘム結合および4結合)および胆汁代謝経路(例えば,胆汁酸合成経路,胆汁分泌経路)がある。本研究では、アヒル卵殻の色形成のトランスクリプトーム基礎を初めて探索し、一つの差異発現遺伝子を獲得し、これらの基礎はアヒル卵殻の色形成の遺伝メカニズムをさらに研究するために価値ある情報を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  剪断 ,  *遺伝子 ,  キレート化合物 ,  卵殻 ,  アヒル ,  胆汁酸 ,  レダクターゼ ,  *トランスクリプトーム ,  *遺伝 ,  *形質転換 ,  アノテーション ,  ラクタム ,  ビニル化合物 ,  ジカルボン酸
準シソーラス用語： 遺伝子オントロジー ,  転写産物 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Blue eggshell ,  Differentially expressed genes ,  Heme ,  Bile

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

物質索引 (1件)： ビリベルジン

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトーム ,  青 ,  殻 ,  形質転換 ,  遺伝子 ,  スクリーニング