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J-GLOBAL ID：201702211685086182   整理番号：17A0099825

You形目 魚類のDNAバーコード分析とYou科DNAバーコードの電子チップの構築【JST・京大機械翻訳】

A DNA barcode for the Scorpaeniformes and construction of a DNA microarray for Scorpaenidae fish

著者 (5件)： Liu Shufang (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Function Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology) ,  Li Xianru (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences) ,  Yang Yu (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences) ,  Yang Shanjun (Third Institute of Oceanography, State Oceanic Administration) ,  Zhuang Zhimeng (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Function Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology)
資料名： Zhongguo Shuichan Kexue  (Zhongguo Shuichan Kexue)
巻： 23  号： 5  ページ： 1006-1022  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2255A  ISSN： 1005-8737  CODEN： ZSKEFS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では、You形目内の各種の快速鑑別方法を確立するため、中国の47種のYou形目種を増幅し、GENBANKに収録されたYou形目の合計23科85属233種の873のチトクロームCオキシダーゼI遺伝子(COI)配列をダウンロードし、その遺伝子構造特性を分析した。結果により、You形目のDNAバーコード遺伝子の塩基変異のうち、ない個が変異し、総座位の82.1%を占めることが分かった。変換部位は70個、転換は位個であり、それぞれ総座位の11.3%と6.6%を占める。遺伝的距離は0~0.019であり,平均遺伝距離は0.003±0.0034であった。属間の遺伝的距離は0.003~0.258であり,平均値は0.086±0.038であった。233種のCOI配列に基づいて構築した系統樹は,227種(97.4%)が独立した枝に属し,高い支持度を持つことを示した。これらの結果に基づき、You科11属39種の魚類のDNAバーコードを例として、25種類の37個の特異的プローブを選出し、これにより、You科の魚類に対する種の快速同定成功率は64.1%であり、DNAバーコードチップはYou科の同定に一定の実行可能性があることが分かった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 中華人民共和国 ,  構造特性 ,  系統樹 ,  オキシダーゼ ,  変異 ,  プローブ ,  遺伝子 ,  *座位 ,  鑑別
準シソーラス用語： 遺伝距離 ,  チトクロームc群 ,  *DNAバーコード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Scorpaeniformes ,  Scorpaenidae ,  DNA barcode ,  DNA microarray

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  魚類以外の水産動物  (FH02030V)

タイトルに関連する用語 (5件)： 魚類 ,  DNAバーコード ,  分析 ,  電子 ,  構築