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J-GLOBAL ID：201702212042624421   整理番号：17A1969038

環状RNAの同定とトマト果実成熟中のそれらの標的【Powered by NICT】

Identification of circular RNAs and their targets during tomato fruit ripening

著者 (8件)： Yin Junliang (College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou, Hubei 434025, China) ,  Yin Junliang (College of Agriculture, Yangtze University, Jingzhou, Hubei 434025, China) ,  Liu Mengyu (College of Horticulture, Shandong Agricultural University, Tai’an, Shandong 271018, China) ,  Ma Dongfang (College of Agriculture, Yangtze University, Jingzhou, Hubei 434025, China) ,  Wu Jiawen (Institute of Plant Nutrition and Soil Science, University of Kiel, Kiel 224118, Germany) ,  Li Shenglan (College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou, Hubei 434025, China) ,  Zhu Yongxing (College of Horticulture and Gardening, Yangtze University, Jingzhou, Hubei 434025, China) ,  Han Bin (Key Laboratory of Plant Molecular Physiology, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093, China)
資料名： Postharvest Biology and Technology  (Postharvest Biology and Technology)
巻： 136  ページ： 90-98  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1912A  ISSN： 0925-5214  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 環状RNA(circRNAs)は動物や植物に豊富に存在し,進化的に保存されていることが分かった。トマトは良く性質が解明されたモデル植物であるが,この種におけるcircRNAsの特徴と機能に関する情報は非常に少ない。本研究では,circRNAsは果実成熟過程に関与しているかどうかを投資するため,大規模シークエンシングを用いた成熟グリーントマト果実及び赤色成熟間circRNAsの変化をモニターした。全705circRNAsがこれらの二試料の340は特異的に調節されたで検出された。CircRNAsは動物の生理学的および生化学的代謝を調節するcis調節因子およびmiRNAスポンジとして機能することが報告された。本研究では,19の差次的発現circRNAsは94標的m RNAの発現を調節するために推定上のmiRNAスポンジとして機能することが見出された。さらに,親遺伝子と標的m RNAの両方の遺伝子オントロジー(GO)濃縮とKyoto Encyclopediaof Genes and Genomes(KEGG)経路のアノテーションは熟成中に差次的に発現したcircRNAsの機能を明らかにした。結果はcircRNAsは代謝適応,ホルモンバランス,および光合成関連経路を仲介することにより果実成熟の調節に関与する可能性があることを明らかにした。に加えて,circRNAsはエチレン応答性転写因子(ERF),squamosaプロモーター結合様蛋白質(SBP)と骨髄芽球症(MYB)プロトオンコジーン蛋白質のような転写因子の標的化を介して転写調節に関与することが予測された。これらの結果は,果実の成熟におけるcircRNAsの役割に光を当て,トマトにおける新しいcircRNAsを識別するのに役立つ。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 光合成 ,  転写因子 ,  動物 ,  mRNA ,  プロモーター領域 ,  ターゲティング ,  生理学 ,  アノテーション ,  *トマト ,  タンパク質
準シソーラス用語： 転写調節 ,  遺伝子オントロジー ,  マイクロRNA ,  *果実の成熟 ,  *環状RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： circRNAs ,  トマト ,  果実熟成 ,  cis調節因子 ,  miRNAスポンジ

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 環状RNA ,  同定 ,  トマト ,  果実成熟 ,  標的