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J-GLOBAL ID：201702212113663763   整理番号：17A1431179

2スペイン個体群における58STRおよび94SNPにおける長さと反復配列の変異【Powered by NICT】

Length and repeat-sequence variation in 58 STRs and 94 SNPs in two Spanish populations

著者 (9件)： Casals Ferran (Genomics Core Facility, Departament de Ciencies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, Parc de Recerca Biomedica de Barcelona, 08003 Barcelona, Catalonia, Spain) ,  Anglada Roger (Genomics Core Facility, Departament de Ciencies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, Parc de Recerca Biomedica de Barcelona, 08003 Barcelona, Catalonia, Spain) ,  Bonet Nuria (Genomics Core Facility, Departament de Ciencies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, Parc de Recerca Biomedica de Barcelona, 08003 Barcelona, Catalonia, Spain) ,  Rasal Raquel (Genomics Core Facility, Departament de Ciencies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, Parc de Recerca Biomedica de Barcelona, 08003 Barcelona, Catalonia, Spain) ,  van der Gaag Kristiaan J. (Division of Biological Traces, Netherlands Forensic Institute, Laan van Ypenburg 6, 2497 GB, The Hague, The Netherlands) ,  Hoogenboom Jerry (Division of Biological Traces, Netherlands Forensic Institute, Laan van Ypenburg 6, 2497 GB, The Hague, The Netherlands) ,  Sole-Morata Neus (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC), Departament de Ciencies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Catalonia, Spain) ,  Comas David (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC), Departament de Ciencies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Catalonia, Spain) ,  Calafell Francesc (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC), Departament de Ciencies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Catalonia, Spain)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 30  ページ： 66-70  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 88スペインのローマ(ジプシー)試料と143カタルーニャにおけるIllumina ForenSeq Primer Mix Aの58のSTR(27常染色体,24Y-STRと7X STRs)と94常染色体SNPの遺伝子型を同定した。本プラットフォームは大規模並列配列決定に基づいているので,反復領域における配列変異を明らかにするために簡単なRスクリプトを使用した。,58STRを横切る,541長さに基づく対立遺伝子,反復配列変動を考慮した後,804種の対立遺伝子となったを見出した。両個体群における全遺伝子座はHardy-Weinberg平衡にあった。両個体群間のF_STはY-STRのSTRと0.1866の常染色体STR,0.0101の常染色体SNP,0.0146に対して0.0178であった。事前統計量を組み合わせて非常に大きいを示した。例えば,すべての常染色体遺伝子座をプールし,容疑者を識別する事前確率はそれぞれ1-(2.3× 10~ 70)および1-(5.9× 10~ 73),ローマとカタルーニャのとなり,トリオにおける偽父を排除する機会は1-(2.6× 10~ 20)と1-(2.0× 10~ 21)である。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *変異 ,  事前確率 ,  常染色体 ,  対立遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *スペイン ,  *個体群 ,  統計量
準シソーラス用語： スクリプト ,  カタロニア ,  ローマ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 大規模並列配列決定 ,  反復配列に基づく対立遺伝子 ,  ローマ ,  Catalans

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： スペイン ,  個体群 ,  反復配列 ,  変異