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J-GLOBAL ID：201702212572257487   整理番号：17A0483930

画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備 第2章 高次解析システムの整備 1 超高速シーケンサーに対応したゲノム断片の整列化機能(3)プログラム運用

著者 (3件)： 伊藤剛 (農業生物資源研) ,  沼寿隆 (農業生物資源研) ,  田中剛 (農業生物資源研)
資料名： 農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果  (農林水産技術会議事務局研究成果)
号： 570  ページ： 16-19  発行年： 2017年03月31日 
JST資料番号： S0070A  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 幅広いユーザーが容易にNGSデータ解析を実行可能なGalaxyを利用したサービスを構築し,内部で動作する個別プログラムの整備を行い,運用開始した。また,これに関連する管理機能等の開発も行った。Galaxy等の利用を促すためワークショップを複数回開催し,高い評価を得た。(著者抄録)

シソーラス用語： 農作物 ,  *畜産物 ,  遺伝情報 ,  *データベース ,  運用 ,  *データ解析
準シソーラス用語： *農産物 ,  ゲノム情報 ,  *プログラム

分類 (2件)： システム設計・解析  (IA02030D) ,  ドキュメンテーション  (FA01020I)

引用文献 (9件)：

• Galaxy.https://galaxyproject.org/(参照日:2016.7.11).
• 情報処理推進機構 セキュリティエンジニアリング.http://www.ipa.go.jp/security/awareness/vendor/software.html(参照日:2016.7.11).
• Assembly By Short Sequences - a de novo, parallel, paired-end sequence assembler. http://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/abyss (参照日 : 2016.7.11).
• BreakDancer. http://breakdancer.sourceforge.net/ (参照日: 2016.7.11).
• Short Oligonucleotide Analysis Package. http://soap.genomics.org.cn/ (参照日: 2016.7. 11).

タイトルに関連する用語 (9件)： 畜産物 ,  ゲノム ,  情報データベース ,  整備 ,  解析システム ,  シーケンサー ,  断片 ,  整列 ,  運用