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J-GLOBAL ID：201702212915148927   整理番号：17A0991697

Historian 祖先配列と進化速度の正確な再構築

Historian: accurate reconstruction of ancestral sequences and evolutionary rates

著者 (1件)： HOLMES Ian H. (Univ. California, CA, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 8  ページ： 1227-1229  発行年： 2017年04月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 祖先配列の変遷の再構築やインデル率のようなパラメーターの推定のために,シミュレーションベンチマーク上は最適なこれまでのツールProtPalは,実用には遅すぎる。本稿で紹介するHistorianは,他のアライメントツール由来の性能を改善する探索法と,ProtPalアルゴリズムの効率良い再実行を組み合わせる。Historianは,https://github.com/evoldoers/historianにて利用可能である。

シソーラス用語： *再構成 ,  *アルゴリズム ,  ヌクレオチド配列 ,  *分子進化 ,  アミノ酸配列
準シソーラス用語： *祖先配列 ,  *進化速度 ,  *再構築 ,  配列アライメント

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (2件)： 進化速度 ,  再構築