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J-GLOBAL ID：201702214412764970   整理番号：17A1619794

QCM-D/MALDI-ToF/MSによる細菌コンディショニング膜からの表面付着蛋白質同定を容易にする新しいデータ処理ルーチン

A new data processing routine facilitating the identification of surface adhered proteins from bacterial conditioning films via QCM-D/MALDI-ToF/MS

著者 (6件)： HOHMANN Siegfried (Karlsruhe Inst. of Technol. (KIT), Eggenstein-Leopoldshafen, DEU) ,  NEIDIG Anke (Karlsruhe Inst. of Technol. (KIT), Eggenstein-Leopoldshafen, DEU) ,  KUEHL Boris (Karlsruhe Inst. of Technol. (KIT), Eggenstein-Leopoldshafen, DEU) ,  KIRSCHHOEFER Frank (Karlsruhe Inst. of Technol. (KIT), Eggenstein-Leopoldshafen, DEU) ,  OVERHAGE Joerg (Carleton Univ., Ontario, CAN) ,  BRENNER-WEISS Gerald (Karlsruhe Inst. of Technol. (KIT), Eggenstein-Leopoldshafen, DEU)
資料名： Analytical & Bioanalytical Chemistry  (Analytical & Bioanalytical Chemistry)
巻： 409  号： 25  ページ： 5965-5974  発行年： 2017年10月 
JST資料番号： E0425B  ISSN： 1618-2642  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水晶微量天秤モニタリング(QCM-D)センサチップとマトリックス支援レーザ脱離/イオン化飛行時間質量分析(MALDI-ToF/MS)を組み合わせて,細菌コンディショニング膜からの表面付着蛋白質を同定した。緑膿菌PAO1蛋白質の理論トリプシンペプチド及びPHPスクリプトによるXMLデータベースからなる新しいデータ処理ツールを用いることで,表面付着蛋白質40種を同定できることが分かった。ソフトウェアPS²によるMS/MS前駆体の質量予測は蛋白質ペプチドの選択的フラグメンテーションを可能にし,必要試料量を削減できるので,少量複合混合物の解析に有用なものと考察した。

シソーラス用語： 微量天秤 ,  *MALDI-TOF MS ,  タンデム質量分析 ,  *緑膿菌 ,  条件付け ,  *タンパク質 ,  表面 ,  *データ処理 ,  ソフトウェア ,  微量分析 ,  データベース ,  同定 ,  センサ ,  ペプチド ,  *飛行時間法
準シソーラス用語： 水晶微量天秤 ,  MALDI-TOF MS/MS ,  コンディショニング ,  *表面蛋白質 ,  センサチップ

分類 (3件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  数値計算  (JE02000J) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： QCM-D ,  MALDI-TOF ,  細菌 ,  コンディショニング ,  蛋白質同定 ,  ルーチン