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J-GLOBAL ID：201702215231844065   整理番号：17A0880971

尿路病原性Escherichia coliの系統発生解析のための多重リアルタイムPCRアッセイの開発【Powered by NICT】

Development of a multiplex real-time PCR assay for phylogenetic analysis of Uropathogenic Escherichia coli

著者 (2件)： Hasanpour Mojtaba (The Persian Gulf Marine Biotechnology Research Center, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran) ,  Najafi Akram (The Persian Gulf Marine Biotechnology Research Center, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran)
資料名： Journal of Microbiological Methods  (Journal of Microbiological Methods)
巻： 137  ページ： 25-29  発行年： 2017年 
JST資料番号： H0882A  ISSN： 0167-7012  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 尿路病原性大腸菌(UPEC)は,尿路感染症(UTI)の全エピソードの中で80 90主要病原体原因%であった。最近,E.coli株はA,B1,B2,C,D,E,F,及びクレードを含む八つの主要な系統発生群に分けた。本研究はE.coli株の系統発生群を検出できる迅速,高感度,特異的マルチプレックスリアルタイムPCR法を開発することを目的とした。本研究では,全七の標的遺伝子の存在は,著者らの以前の系統学的研究で確認されたE.coli株(尿路感染症患者から分離された)で行った。融解曲線分析法を用いたEvaGreenベースシングルプレックス及びマルチプレックスリアルタイムPCRは,これらの遺伝子の同時検出及び分化のために設計した。プライマーは,主に各ピーク間の融解温度(T_m)82°Cから93°Cの範囲のアンプリコンの生成と温度差1.5°C以上のに基づいて選択した。本研究で開発されたマルチプレックスリアルタイムPCRアッセイは八つの主要な系統発生群を検出することに成功した。七つの明確な融解ピークを識別,内部制御のためのTm値は93±0.8のarpA,chuAに対して89.2±0.1,yjaA86.5±0.1,TspE4C2 82.3±0.2,trpAgpCに対して87.8±0.1,arpAgpE遺伝子の85.4±0.6,及び91±0.5であった。著者らの知る限り,本研究はこれらの七種の標的遺伝子の同時かつ離散検出のための開発された最初の融解曲線に基づくリアルタイムPCRアッセイである。著者らの発見によるとこの手法はE.coli株のルーチンphylotypingに対する迅速で信頼性のある費用対効果の高い代替手段になる可能性を持つことを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *系統発生 ,  患者 ,  尿路感染症 ,  *大腸菌 ,  融点 ,  高感度 ,  *病原性 ,  *リアルタイムPCR法 ,  信頼性 ,  遺伝子 ,  病原体
準シソーラス用語： 融解曲線 ,  アンプリコン ,  標的遺伝子 ,  *尿路 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Escherichia coli ,  系統発生群 ,  EvaGreenリアルタイムPCR ,  融解曲線

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (9件)： 尿路 ,  病原性 ,  Escherichia ,  系統発生 ,  解析 ,  多重 ,  リアルタイムPCR ,  アッセイ ,  開発