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J-GLOBAL ID：201702215705161182   整理番号：17A1518921

異なる成長時期におけるニホンジカの枝角トランスクリプトーム解析についての解析を行った。【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Analysis of Sika Deer Antlers at Different Stages

著者 (6件)： Zhang Ranran (中国農業科学院特産研究所特種経済動物分子生物重点実験室,長春,130112) ,  Liu Huamiao (中国農業科学院特産研究所特種経済動物分子生物重点実験室,長春,130112) ,  Wang Lei (中国農業科学院特産研究所特種経済動物分子生物重点実験室,長春,130112) ,  Xing Xiumei (中国農業科学院特産研究所特種経済動物分子生物重点実験室,長春,130112) ,  Su Weilin (中国農業科学院特産研究所特種経済動物分子生物重点実験室,長春,130112) ,  Gao Bing (中国農業科学院特産研究所特種経済動物分子生物重点実験室,長春,130112)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 48  号： 2  ページ： 235-242  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は、異なる生長時期におけるニホンジカ枝角のトランスクリプトームの差異を調査し、ニホンジカの枝角のトランスクリプトーム情報を豊かにすることである。5つの成長時期(10,20,28,44,66日)のニホンジカの枝肉組織を試験試料として,Illumina HiSeqTM2500を用いて高スループット配列決定を行い,配列決定,遺伝子注釈などの生物情報学的方法により分析した。結果:配列決定と転写により、375 657本のcontigsを獲得し、平均長さは688bp、329946個のunigenes、平均長さは534bpであった。Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-prot、KEGG、GOなどの7つの大データベースに対して、90.07% unigenesは成功的な注釈を得た。そのうち、39674個(12.02%)の遺伝子はGOデータベースに成功し、level 2レベルでは41種類に分類された。17732(5.37%)の遺伝子は,KOGの26のカテゴリーに成功裏に注釈された。5つの成長期における鹿茸の転写ライブラリーに対して比較分析を行った結果、合計509の差異遺伝子が発見され、そのうち407の差異発現遺伝子はGOデータベースに成功し、主にシグナル伝達、酸化還元、転写調節、プロテアーゼ分解などの生物学的過程であった。。・・・.は、主にシグナル伝達、酸化還元、転写調節、プロテアーゼ分解などの生物学的過程を示した。その中で、転写調節遺伝子PER1、EGR1の発現は鹿茸の成長に伴い増加し、GAS1は逆に、鹿茸の生長につれて低下し、PER1、EGR1、GAS1などの転写因子が鹿茸の生長過程において重要な調節作用を発揮することが推測された。本研究では、ハイスループット配列決定技術を用いて、異なる生長時期のニホンジカの枝角組織に対してトランスクリプトーム配列分析と分析を行い、異なる生長時期におけるニホンジカの異なる発現遺伝子をスクリーニングし、差異発現遺伝子の機能を獲得した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酸化還元反応 ,  遺伝子 ,  *トランスクリプトーム ,  アノテーション ,  *ニホンジカ ,  転写因子 ,  きのこ ,  データベース
準シソーラス用語： 配列解析 ,  生物学的過程 ,  転写調節 ,  バイオインフォマティクス ,  ハイスループット ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *枝角 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： sika deer ,  antler ,  transcriptome ,  differentially expressed genes

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 成長 ,  ニホンジカ ,  枝角 ,  トランスクリプトーム解析 ,  解析