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J-GLOBAL ID：201702215712770251   整理番号：17A0142802

非冗長データベースを構築するためのCD HITの評価【Powered by NICT】

Evaluation of CD-HIT for constructing non-redundant databases

著者 (5件)： Qingyu Chen (Dept. of Computing & Information Systems, University of Melbourne, Parkville, Victoria 3010, Australia) ,  Yu Wan (Centre for Systems Genomics, University of Melbourne, Parkville, Victoria 3010, Australia) ,  Yang Lei (Dept. of Computing & Information Systems, University of Melbourne, Parkville, Victoria 3010, Australia) ,  Zobel Justin (Dept. of Computing & Information Systems, University of Melbourne, Parkville, Victoria 3010, Australia) ,  Verspoor Karin (Dept. of Computing & Information Systems, University of Melbourne, Parkville, Victoria 3010, Australia)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： BIBM  ページ： 703-706  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： CD HITは配列冗長性を低減するための最も一般的なツールの一つであり,最新の方法であると考えられている。入力データベースを減少させるいくつかの代表的な配列に冗長性を最小化し,ユーザが定義した閾値配列同一性の下ですることを試みた。CD HITの出力における冗長性の包括的評価を提示し,冗長性に異なる同一性しきい値と新しい評価データの影響を調べた。しきい値と冗長性の間の関係は驚くべき弱いことを示した。低同一性しきい値を設定するCD HITの応用は,効率と精度の両方での実質的な分解を受ける可能性がある。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 配列相同性 ,  *データベース ,  冗長性
準シソーラス用語： 入力データ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (4件)： 冗長データ ,  構築 ,  Cd ,  評価