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J-GLOBAL ID:201702216235122998   整理番号:17A1554458

差次的に発現した遺伝子の切断された核ノルムによる正則化ロバスト主成分分析【Powered by NICT】

Robust Principal Component Analysis Regularized by Truncated Nuclear Norm for Identifying Differentially Expressed Genes
著者 (5件):
資料名:
巻: 16  号:ページ: 447-454  発行年: 2017年 
JST資料番号: W1381A  ISSN: 1536-1241  CODEN: ITMCEL  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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千遺伝子の差次的に発現した遺伝子の同定は,困難な課題である。ロバスト主成分分析(RPCA)は差次的に発現した遺伝子の同定に有効な方法である。RPCA法は,核型ノルムはランク関数を近似する。しかし,理論的研究は,核型ノルムはすべての特異値を最小化することが分かったので,ランク関数を近似するために最良の解決策ではないかもしれない。切断された核型ノルムがいくつかのより小さい特異値の和,核型ノルムより階数関数の優れた近似を達成する可能性があるとして定義される。RPCAの核ノルムを置換切断核ノルム,切断された核型ノルム(TRPCA)により正則化されたロバストな主成分分析と名付けられたによる新しい方法を提案した。法は低ランク行列およびスパースマトリックスへのゲノムデータの観測行列を分解する。遺伝子はスパース信号として考えることができるため,差次的に発現した遺伝子は,スパース摂動信号として見られている。,差次的に発現した遺伝子は疎行列に従って同定できた。癌ゲノムアトラスデータ上での実験結果により,TRPCA法は差次的に発現した遺伝子の同定におけるその他の最先端レベル手法よりも優れていることを示した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】
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分類 (2件):
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遺伝子発現  ,  分子遺伝学一般 

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