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J-GLOBAL ID：201702216698748956   整理番号：17A0758317

無標識深部ショットガンプロテオミクスはトマト果実組織発生時の蛋白質動力学を明らかにする【Powered by NICT】

Label-free deep shotgun proteomics reveals protein dynamics during tomato fruit tissues development

著者 (9件)： Szymanski Jedrzej (Department of Plant and Environmental Sciences, Weizmann Institute of Science, Rehovot, 76100, Israel) ,  Szymanski Jedrzej (Blavatnik School of Computer Science, Tel-Aviv University, Tel-Aviv, 69978, Israel) ,  Levin Yishai (The Nancy and Stephen Grand Israel National Center for Personalized Medicine, Weizmann Institute of Science, Rehovot, 76100, Israel) ,  Savidor Alon (The Nancy and Stephen Grand Israel National Center for Personalized Medicine, Weizmann Institute of Science, Rehovot, 76100, Israel) ,  Breitel Dario (Metabolic Biology Department, John Innes Centre, Norwich, NR4 7UH, UK) ,  Chappell-Maor Louise (Department of Plant and Environmental Sciences, Weizmann Institute of Science, Rehovot, 76100, Israel) ,  Heinig Uwe (Department of Plant and Environmental Sciences, Weizmann Institute of Science, Rehovot, 76100, Israel) ,  Topfer Nadine (Department of Plant and Environmental Sciences, Weizmann Institute of Science, Rehovot, 76100, Israel) ,  Aharoni Asaph (Department of Plant and Environmental Sciences, Weizmann Institute of Science, Rehovot, 76100, Israel)
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 90  号： 2  ページ： 396-417  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 質量分析に基づく技術における最近の革新は,蛋白質発現の深いカバレッジを可能にした。計り知れない価値にもかかわらずとトランスクリプトミクスとは対照的に,作物の研究のほんの一握りしか,包括的プロテオーム分析を行った。ここでは,二つの重要な組織と五発育段階のトマト果実の大規模ショットガンプロテオミクスプロファイリングを示した。全7738の個々の蛋白質群が同定され,少なくとも分析した組織または段階の一つで確実に測定した。分析の深さは61の差次的に発現した転写因子の同定,有名な成熟に関連した調節因子とエチレンシグナル伝達の要素を含むを可能にした。重要なことに,著者らはトマト代謝ネットワークにおける全ての予測した酵素反応の83%に関与する蛋白質を測定した。,主要な代謝経路における反応の完全な組を表す蛋白質が同定され,サイトゾルと色素体イソプレノイド,フェニルプロパノイド経路を含んでいた。データは発現パターン,弱い転写蛋白質発現対応の光で非常に重要となるに従って蛋白質イソ型間の識別を可能にした。最後に,特定のプロセスに関連した蛋白質豊度の変化の可視化は成長中の果実における果皮及び果肉組織の特異な眺めを提供した。本研究では,既存のゲノミクス,トランスクリプトミクスおよびメタボロミクス資源に新しい次元を加えた。はトマトと追加種,現在転写に焦点を当てているが翻訳と翻訳後研究を促進すると思われる。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： プロテオーム ,  *トマト ,  テルペノイド ,  代謝経路 ,  成長段階 ,  サイトゾル ,  *タンパク質 ,  色素体 ,  転写因子 ,  *プロテオミクス ,  酵素反応
準シソーラス用語： フェニルプロパノイド ,  トランスクリプトーム解析 ,  蛋白質発現 ,  *ショットガンプロテオミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： トマト(Solanum lycopersicum) ,  プロテオミクス ,  果実発育 ,  果実成熟 ,  二次代謝

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  野菜  (FC03043X)

タイトルに関連する用語 (7件)： 無標識 ,  深部 ,  ショットガンプロテオミクス ,  トマト ,  果実 ,  組織 ,  蛋白質動力学