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J-GLOBAL ID：201702217641327159   整理番号：17A1378746

AA9ファミリーからの3400種の溶解性多糖類オキシダーゼのバイオインフォマティクス解析【Powered by NICT】

A bioinformatics analysis of 3400 lytic polysaccharide oxidases from family AA9

著者 (13件)： Lenfant Nicolas (Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques, Centre National de la Recherche Scientifique, Universite d’Aix-Marseille, France) ,  Lenfant Nicolas (Institut National de la Recherche Agronomique, USC 1408 AFMB, 13288 Marseille, France) ,  Hainaut Matthieu (Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques, Centre National de la Recherche Scientifique, Universite d’Aix-Marseille, France) ,  Hainaut Matthieu (Institut National de la Recherche Agronomique, USC 1408 AFMB, 13288 Marseille, France) ,  Terrapon Nicolas (Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques, Centre National de la Recherche Scientifique, Universite d’Aix-Marseille, France) ,  Terrapon Nicolas (Institut National de la Recherche Agronomique, USC 1408 AFMB, 13288 Marseille, France) ,  Drula Elodie (Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques, Centre National de la Recherche Scientifique, Universite d’Aix-Marseille, France) ,  Drula Elodie (Institut National de la Recherche Agronomique, USC 1408 AFMB, 13288 Marseille, France) ,  Lombard Vincent (Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques, Centre National de la Recherche Scientifique, Universite d’Aix-Marseille, France) ,  Lombard Vincent (Institut National de la Recherche Agronomique, USC 1408 AFMB, 13288 Marseille, France) ,  Henrissat Bernard (Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques, Centre National de la Recherche Scientifique, Universite d’Aix-Marseille, France) ,  Henrissat Bernard (Institut National de la Recherche Agronomique, USC 1408 AFMB, 13288 Marseille, France) ,  Henrissat Bernard (Department of Biological Sciences, King Abdulaziz University, Jeddah, Saudi Arabia)
資料名： Carbohydrate Research  (Carbohydrate Research)
巻： 448  ページ： 166-174  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0929A  ISSN： 0008-6215  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： AA9ファミリーの溶解性多糖類モノオキシゲナーゼは,セルロースおよび関連多糖類中のグリコシド結合の酸化的開裂を触媒する。AA9LPMOsのN末端半分はこれらの酵素でこれまで見いだされた基板単純とは矛盾している巨大な配列変異性を示した。ファミリーに広がる高multigenicityの原因を理解するために,著者らはファミリーAA9LPMOsの3400配列のN末端領域のクラスター分析を行い,機能的差異を伴う可能性があることを遠位可視特徴を持つクラスタの同時計数を評価した。局所ペアワイズアラインメントに基づく方法は世界的な多重アラインメントの落し穴を避けるために考案した。著者らの解析は,64クラスタの定義,機能不明のモジュールと銅触媒を保持していることをヒスチジンブレースの最初の残基で顕著なH→R置換の,炭水化物結合モジュールの存在のような,LPMOファミリーAA9に関連したいくつかの可視特徴を分離に成功を可能にした。著者らの解析は,配列類似性は分類学のみを従わないAA9配列のN末端半分の超可変性は,ランダム進化により駆動されないことを示した。結果は,いくつかのクラスタはおそらくセルロースの代わりにキチンを標的とすることができ,C1またはC4酸化(またはその欠如)の優先性が強い進化的制約を構成するようには見えないことを示唆した。進化的立場では,ヒスチジンブレースの保存以外の配列のN末端半分に適用されるほとんど制約であると思われる。AA9LPMOsのN末端半分に適用する弱い進化的制約は,それらの超可変性とmultigenicityの両方を説明した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *オキシダーゼ ,  類似性 ,  クラスタ ,  銅触媒 ,  *溶解性 ,  モノオキシゲナーゼ ,  キチン ,  *多糖類 ,  クラスタ分析 ,  セルロース ,  アラインメント
準シソーラス用語： 炭水化物結合モジュール ,  アミノ末端 ,  グリコシド結合 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 溶解性多糖類モノオキシゲナーゼ ,  進化 ,  バイオインフォマティクス ,  モジュール構造 ,  位置選択性 ,  真菌のライフスタイル

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  多糖類  (CF10054P)

タイトルに関連する用語 (5件)： ファミリー ,  溶解性 ,  多糖類 ,  オキシダーゼ ,  バイオインフォマティクス解析