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J-GLOBAL ID：201702218239536836   整理番号：17A1696847

O2′-トリフェニレンおよびコロネン官能化RNAモノマー類のストランド間ジッパー配列を有する二本鎖プローブを用いた混合配列DNAの認識【Powered by NICT】

Recognition of mixed-sequence DNA using double-stranded probes with interstrand zipper arrangements of O2′-triphenylene- and coronene-functionalized RNA monomers

著者 (4件)： Karmakar Saswata (Department of Chemistry, University of Idaho, Moscow, ID-83844, USA. [e-mail]) ,  Guenther Dale C. ,  Gibbons Bradley C. ,  Hrdlicka Patrick J.
資料名： Organic & Biomolecular Chemistry  (Organic & Biomolecular Chemistry)
巻： 15  号： 44  ページ： 9362-9371  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0499C  ISSN： 1477-0520  CODEN： OBCRAK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 特異的混合配列二本鎖DNA(dsDNA)領域の認識を可能にするハイブリダイゼーションに基づくプローブの開発は,分子生物学,バイオテクノロジー,及び医薬におけるそれらの潜在的応用のために大きな関心である。最近2′-零-(ピレン-1-イル)メチルRNAモノマーのようなインターカレータ官能化ヌクレオチドの+1鎖間ジッパー配列を持った核酸二本鎖である混合配列二本鎖DNAターゲットの認識,染色体DNAを含む本質的に活性化されることを実証した。本研究では,著者らの以前の構造活性相関研究に対するフォローアップとこれらのいわゆるインベーダープローブのdsDNA認識効率はピレンより大きいインターカレータを用いて改善できるかどうか調べた。2′-O-(トリフェニレン-2-イル)メチル-ウリジン単量体Xと2′-O-(コロネン-1-イル)メチル-ウリジン単量体Zで修飾したオリゴデオキシリボヌクレオチドは,相補的DNA(最大13°Cと20°Cの改質当たりΔT_mの)を持つ異常に安定化された二本鎖を形成する。X線及びZ単量体に基づくインベーダープローブである例外的な結合特異性を持つモデルdsDNA標的を認識することを示したが,2′-O-(ピレン-1-イル)メチル-ウリジン単量体で修飾した参照プローブよりも効率が劣る。本研究からの洞察は,Invaderプローブのさらなる最適化に有用である。Copyright 2018 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *官能化 ,  *RNA【核酸】 ,  ストランド ,  DNA【核酸】 ,  認識 ,  分子生物学 ,  バイオテクノロジー ,  ヌクレオチド ,  *プローブ ,  オリゴヌクレオチド ,  安定化 ,  ピリミジンヌクレオシド ,  リボヌクレオシド ,  芳香族縮合炭化水素
準シソーラス用語： インターカレータ ,  インベーダー法 ,  オリゴデオキシリボヌクレオチド ,  *ジッパー配列 ,  二本鎖DNA ,  医薬品 ,  結合特異性 ,  構造活性相関研究 ,  相補的DNA

分類 (3件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  標識化合物  (CB10050N) ,  四環以上の炭素縮合多環化合物  (CF06090C)

物質索引 (8件)： ウリジン ,  コロネン ,  トリフェニレン ,  ピレン ,  2,2′-エポキシ-2′-デオキシ-2-デオキソウリジン ,  2′-O-(トリフェニレン-2-イルメチル)ウリジン ,  2′-O-(トリフェニレン-2-イルメチル)-5′-O-(4,4′-ジメトキシトリチル)ウリジン ,  2′-O-(トリフェニレン-2-イルメチル)-3′-O-((2-シアノエトキシ)(ジイソプロピルアミノ)ホスフィノ)-5′-O-(4,4′-ジメトキシトリチル)ウリジン

タイトルに関連する用語 (10件)： O2 ,  トリフェニレン ,  コロネン ,  官能化 ,  RNA ,  モノマー類 ,  ストランド ,  ジッパー ,  プローブ ,  DNA