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J-GLOBAL ID：201702218319643612   整理番号：17A0984965

細胞亜集団のデコンボリューションによりDNAメチル化シグネチャーに基づく乳癌の不均一性が明らかになる

Cell subpopulation deconvolution reveals breast cancer heterogeneity based on DNA methylation signature

著者 (9件)： WEN Yanhua (Harbin Medical Univ., CHN) ,  WEI Yanjun (Harbin Medical Univ., CHN) ,  ZHANG Shumei (Harbin Medical Univ., CHN) ,  LI Song (Harbin Medical Univ., CHN) ,  LIU Hongbo (Harbin Medical Univ., CHN) ,  WANG Fang (Harbin Medical Univ., CHN) ,  ZHAO Yue (Harbin Medical Univ., CHN) ,  ZHANG Dongwei (Harbin Medical Univ., CHN) ,  ZHANG Yan (Harbin Medical Univ., CHN)
資料名： Briefings in Bioinformatics  (Briefings in Bioinformatics)
巻： 18  号： 3  ページ： 426-440  発行年： 2017年05月 
JST資料番号： W2342A  ISSN： 1467-5463  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腫瘍の不均一性の推定に関する研究の進歩について総合的に調べた。DNAのメチル化のバイオインフォマティクス解析により,乳癌細胞株と乳癌組織の間の進化的関連が明らかになった。33種類の乳癌細胞株においてDNAメチル化を詳細に解析したところ,細胞株特異的なメチル化パターンが明らかになった。異なる視点からの腫瘍のクローン進化の推定における計算法について調べ,DNAメチル化に基づいて乳癌組織における細胞のサブクローン集団の動力学をモデル化するためのデコンボリューション方法を提唱した。シミュレーションした癌組織および実際の細胞株を詳細に解析した結果,本法により細胞亜集団の組成および割合の推定において満足できる性能および相対的な安定性が得られることが明らかになった。本法を,異なる分子表現型をもつCancer Genome Atlasの異なる細胞亜集団の乳癌患者に適用した。また,臨床的乳癌研究への本デコンボリューション法の現在の適用および将来行われる可能性のある適用について示し,DNAメチル化に基づく腫瘍内不均一性の認識について検討した。その結果,不均一性の推定のために別の臨床コホートにこれらの方法を広範に利用することにより,乳癌および他の癌の治療のための癌の進行の理解および治療的介入のデザインが改善されると推測された。

シソーラス用語： 乳房腫瘍 ,  培養細胞 ,  *デコンボリューション ,  メチル化 ,  *不均一性 ,  情報科学 ,  生物学 ,  遺伝現象
準シソーラス用語： *DNAメチル化 ,  クローン進化 ,  バイオインフォマティクス解析 ,  *細胞株 ,  *乳癌

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 細胞 ,  亜集団 ,  デコンボリューション ,  DNAメチル化 ,  シグネチャー ,  乳癌 ,  不均一性