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J-GLOBAL ID：201702219158125049   整理番号：17A1048139

DNAザイムの分割に埋め込まれたアプタマーからのNa +依存FRET信号を可能にする【Powered by NICT】

Splitting a DNAzyme enables a Na⁺-dependent FRET signal from the embedded aptamer

著者 (3件)： Zhou Wenhu (Xiangya School of Pharmaceutical Sciences, Central South University, Changsha, Hunan 410013, China) ,  Ding Jinsong ,  Liu Juewen
資料名： Organic & Biomolecular Chemistry  (Organic & Biomolecular Chemistry)
巻： 15  号： 33  ページ： 6959-6966  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0499C  ISSN： 1477-0520  CODEN： OBCRAK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近,少数のNa +特異的RNA切断DNAザイムが報告されており,Na +アプタマーはNaA43とCe13d DNAザイムから同定した。これらDNAザイムと埋め込まれたアプタマーは,Na +検出のために使用した。本研究では,蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を用いてCe13d DNAザイムのNa +依存性折畳みを研究した。FRETドナーとアクセプターがそれぞれDNAザイムの末端基で標識化した場合,Na +は明らかな両端間距離変化を誘導できず,剛性全体構造を示唆した。この剛性を緩和するために,Ce13d DNAザイムは酵素と基質鎖の両方に種々のサイトで分割した。分割構造のNa +結合活性は2 アミノプリン蛍光,酵素活性,Tb 3+-増感ルミネセンス,DMSフットプリント法により特性化した。種々の構築物の中で,Na +結合を保持していた唯一のものでは,開裂部位で分割し,この構築物は,分裂サイト付近の二染料で標識した。FRET結果は26mM Na +のK_dのNa +依存性折畳みを示した。本研究では,この新しいアプタマーへのNa +結合に関連する重要な構造情報,それはバイオセンサ設計における将来の研究に有用である可能性を提供する。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  *RNAヌクレオチジルトランスフェラーゼ ,  核酸 ,  *蛍光共鳴エネルギー移動 ,  畳 ,  末端基 ,  標識法 ,  酵素活性度 ,  バイオセンサ ,  カチオン ,  ナトリウム化合物 ,  金属イオン ,  範囲
準シソーラス用語： *DNAザイム ,  FRET【移動】 ,  *アプタマー ,  ドナー・アクセプター系 ,  ナトリウムイオン ,  フットプリント ,  開裂 ,  酵素活性 ,  標識化

分類 (3件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

物質索引 (1件)： 2-アミノプリン

タイトルに関連する用語 (4件)： DNAザイム ,  アプタマー ,  Na ,  FRET