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J-GLOBAL ID：201702219596576180   整理番号：17A0317147

系統Arabidopsis thaliana(シロイヌナズナ)の地球規模コレクションにおけるエピゲノム多様性【Powered by NICT】

Epigenomic Diversity in a Global Collection of Arabidopsis thaliana Accessions

著者 (31件)： Kawakatsu Taiji (Plant Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Kawakatsu Taiji (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Kawakatsu Taiji (Genetically Modified Organism Research Center, National Institute of Agrobiological Sciences, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan) ,  Huang Shao-shan Carol (Plant Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Huang Shao-shan Carol (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Jupe Florian (Plant Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Jupe Florian (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Sasaki Eriko (Gregor Mendel Institute, Austrian Academy of Sciences, Vienna Biocenter, 1030 Vienna, Austria) ,  Schmitz Robert J. (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Schmitz Robert J. (Department of Genetics, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA) ,  Urich Mark A. (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Castanon Rosa (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Nery Joseph R. (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Barragan Cesar (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  He Yupeng (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Chen Huaming (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Dubin Manu (Gregor Mendel Institute, Austrian Academy of Sciences, Vienna Biocenter, 1030 Vienna, Austria) ,  Lee Cheng-Ruei (Gregor Mendel Institute, Austrian Academy of Sciences, Vienna Biocenter, 1030 Vienna, Austria) ,  Wang Congmao (Department of Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, 72076 Tuebingen, Germany) ,  Wang Congmao (Institute of Digital Agriculture, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou, Zhejiang, 310021, PR China) ,  Bemm Felix (Department of Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, 72076 Tuebingen, Germany) ,  Becker Claude (Department of Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, 72076 Tuebingen, Germany) ,  O’Neil Ryan (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  O’Malley Ronan C. (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Quarless Danjuma X. (Human Biology, J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Schork Nicholas J. (Human Biology, J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Weigel Detlef (Department of Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, 72076 Tuebingen, Germany) ,  Nordborg Magnus (Gregor Mendel Institute, Austrian Academy of Sciences, Vienna Biocenter, 1030 Vienna, Austria) ,  Ecker Joseph R. (Plant Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Ecker Joseph R. (Genomic Analysis Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA) ,  Ecker Joseph R. (Howard Hughes Medical Institute, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA 92037, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 166  号： 2  ページ： 492-505  発行年： 2016年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エピゲノムはゲノム接近性,機能性,及び三次元構造を調整する。後成的変異は転写,表現型に影響を与えることができるので,適応に寄与する可能性がある。ここに著者らは,Arabidopsis thalianaの1001ゲノム収集からの1,107の高品質一塩基分解能メチロームと1,203トランスクリプトームを報告した。メチル化変異の遺伝学的基礎は高度に複雑であるが,地理的起源はゲノムワイドなDNAメチル化レベルとエピ対立遺伝子による遺伝子発現の変化の主要な予測因子である。シストロームとepicistromeデータセットとの比較は,転写因子結合部位,メチル化,ヌクレオチド変化,および共発現モジュールの間の関係を明らかにした。最も多様なゲノムの九の物理的地図はトランスポゾンや他の構造変異体がエピゲノムを形成する,免疫遺伝子に劇的な効果を有するかを明らかにした。1001EpigenomesプロジェクトはDNAメチル化の変化は,最も研究されているモデル植物の自然集団における分子及び非分子表現型に寄与するかを理解するための包括的な資源を提供する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 表現型 ,  *Arabidopsis thaliana ,  メチル化 ,  *てんかん ,  分解能 ,  遺伝学 ,  トランスポゾン ,  対立遺伝子 ,  *ゲノム ,  *Arabidopsis ,  トランスクリプトーム ,  アクセシビリティ
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  三次元構造 ,  *エピゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 系統 ,  Arabidopsis ,  シロイヌナズナ ,  地球規模 ,  コレクション ,  エピゲノム ,  多様性