マイクロアレイデータフィルタリング,バイアス認識,正規化,と発現解析を簡単化するアレイ解析管理者の自動DNAマイクロアレイ解析ツール【Powered by NICT】

von der Haar Marcel; Lindner Patrick; Scheper Thomas; Stahl Frank

文献

J-GLOBAL ID：201702219884407941 整理番号：17A1244238

マイクロアレイデータフィルタリング,バイアス認識,正規化,と発現解析を簡単化するアレイ解析管理者の自動DNAマイクロアレイ解析ツール【Powered by NICT】

Array Analysis Manager-An automated DNA microarray analysis tool simplifying microarray data filtering, bias recognition, normalization, and expression analysis

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資料名：
巻： 17 号： 8 ページ： 841-846 発行年： 2017年
JST資料番号： W1333A ISSN： 1618-0240 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Desoxyribonucleic核酸(DNA)マイクロアレイ実験は大きなデータセットを発生させた。内の潜在的情報を利用するために,複数のフィルタリング,正規化,及び分析法を適用する必要がある。根底にある物理的,化学的,および統計的プロセスの詳細な知識はこの分析の成功に重要である。しかし,DNAマイクロアレイ応用と実験者背景の学際性のために,公表された分析は,方法論,例えば,大きく異なっていた。これは研究と研究分野の理解と比較可能性を厳しく制限する。本研究では,新規なエンドユーザソフトウェア,自動的にフィルタリング,正規化,二チャネルマイクロアレイ実験データを解析するために開発したを示した。ユーザはマルチスキャンアプローチを用いた拡張動的強度範囲を用いた単一チップ,染料交換,およびループ実験を解析することを可能にする。,著者らの知る限り,これは最初の解析ソフトウェアソリューション,光退色,人工ニューラルネットワークによる自動検出を説明できることである。ユーザはバイアス最小化に関する各印加正規化の有効性に関するフィードバックが得られた。発現解析のための標準化された方法は遺伝子発現オムニバス(GEO)フォーマットにて結果を輸出する可能性も含めた。このソフトウェアはマイクロアレイ解析プロセスを単純化し,実験者は再現性と比較可能性に寄与する解析過程について教育を受けた意思決定を行うことを支援するように設計した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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酵素の応用関連 , 微生物代謝産物の生産

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