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J-GLOBAL ID：201702221054763089   整理番号：17A1747551

ゴマ全ゲノムにおけるHsp70遺伝子の同定と生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification and bioinformatics analysis of Hsp70 gene family in Sesamum indicum

著者 (4件)： Xu Jianwen (江蘇省農業科学院経済作物研究所,江蘇 南京,210014) ,  Zhao Jun (江蘇省農業科学院経済作物研究所,江蘇 南京,210014) ,  Liu Jianguang (江蘇省農業科学院経済作物研究所,江蘇 南京,210014) ,  Xiao Songhua (江蘇省農業科学院経済作物研究所,江蘇 南京,210014)
資料名： Jiangsu Daxue Xuebao  (Jiangsu Daxue Xuebao)
巻： 33  号： 3  ページ： 493-502  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2703A  ISSN： 1000-4440  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 隠れMarkov連鎖モデル(HMM)を用いて、ゴマ全ゲノムHsp70遺伝子に対して系統分析を行い、21個のHsp70遺伝子を同定し、そのうち17個はDnak遺伝子サブファミリーに属し、4個はHsp110/SSE遺伝子サブファミリーに属した。系統樹分析とサブ細胞定位の結果により、ゴマ21個のHsp70遺伝子を6つのサブグループに分け、その中のIサブグループは3つで、葉緑体に定位している;IIサブグループは2つあり、ミトコンドリアに局在している。IIIサブグループは5つで,小胞体に局在していた。IVサブグループは6つで,細胞質マトリックスに位置していた。Vサブグループは4つであり,Hsp110/SSE遺伝子ファミリーに属していた。VIサブグループは1つであった。Hsp70遺伝子プロモーター領域のシス作用要素の機能予測結果により、Hsp70遺伝子はゴマの生長発育とストレス応答などの生理過程に参与することが示された。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  定位 ,  プロモーター領域 ,  ミトコンドリア ,  系統樹 ,  葉緑体 ,  予測 ,  小胞体 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： 生理学的過程 ,  ストレス応答 ,  シスエレメント ,  遺伝子ファミリー ,  Markov連鎖モデル ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Sesamum indicum ,  Hsp70 gene ,  identification ,  bioinformatics analysis

分類 (3件)： 海藻類  (FH02040G) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (7件)： ゴマ ,  ゲノム ,  HSP70 ,  遺伝子 ,  同定 ,  生物情報学 ,  解析