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J-GLOBAL ID：201702222190749819   整理番号：17A1520851

リュウガンmiR171ファミリーの進化特性とその発現分析【JST・京大機械翻訳】

Evolutionary Characterization and Expression of miR171 Family in Dimocarpus longan Lour

著者 (9件)： Ceng Youjing (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Lin Yuling (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Cui Tongtong (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Chen Xiaohui (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Xu Xiaoping (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Zhang Zihao (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Cheng Chunzhen (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Chen Yukun (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002) ,  Lai Zhongxiong (福建農林大学 園芸植物生物工程研究所,福州,350002)
資料名： Xibei Zhiwu Xuebao  (Xibei Zhiwu Xuebao)
巻： 37  号： 2  ページ： 258-265  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2196A  ISSN： 1000-4025  CODEN： XZXUEV  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： リュウガンのmiR171ファミリーの進化特性と機能を理解するために,著者らは,それらの機能について研究した。本研究では、リュウガンのmRNAとmiRNAデータベースから得られたmiR171ファミリーの7つの前駆体配列(pre-miRNA)と9つの成熟体配列に基づいて、生物情報学的予測と発現分析を行った。 mfold予測により、以下のことを示した。pre-miR171ファミリーのメンバーは典型的な二次構造を形成し、その最小折畳み自由エネルギー(dG)は-39.37~-55.13 kal/molであった。さらに,ファミリーメンバーの中には,pre-miR117-scaffold112とpre-miR171f-scaffold38があることが示された。他のメンバーに含まれている成熟配列は,vv-miR171a,ptc-miR171f,およびctri-miR171のような成熟体と完全に一致していた,そして,NJ系統樹によって発見された。リュウガンのpre-miR171ファミリーは,柑橘類,Populus tomentosaと高い類似性を示し,psRNAtarget標的の予測により,リュウガンのmiR171ファミリーの主な標的はScarecrow-like 6で,他の植物のmiR171と同じであることが示された。リアルタイム蛍光定量PCR分析により、pre-miR171ファミリーのメンバーはいずれもリュウガンの雄花において発現が増加し、果実における発現量は低下した。研究により、リュウガンのmiR171ファミリーは進化過程において高度な保存性を持ち、リュウガンの生長発育過程において主に雄花の形成に関与していると考えられている。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  類似性 ,  系統樹 ,  蛍光 ,  二次構造 ,  前駆体 ,  定量的PCR法 ,  折畳み ,  mRNA ,  ハコヤナギ属 ,  *予測 ,  自由エネルギー
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  マイクロRNA ,  *リュウガン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Dimocarpus longan Lour. ,  miR171 ,  bioinformatics ,  real-time fluorescence quantification

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (5件)： リュウガン ,  ファミリー ,  進化 ,  発現 ,  分析