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J-GLOBAL ID：201702222297256515   整理番号：17A1753763

部分的な分離条件下でのヒラメの成長形質のQTLの主成分の位置決めは,主に,以下のことを示した。【JST・京大機械翻訳】

Mapping QTLs for principle components of growth traits using dis-torted markers in Japanese flounder Paralichthys olivaceus

著者 (6件)： Li Ning (上海海洋大学水産与生命学院,上海 201306;中国水産科学研究院,農業部水生動物基因組重点実験室,北京 100141) ,  Zhang Liyi (中国水産科学研究院,農業部水生動物基因組重点実験室,北京 100141;南京農業大学无錫漁業学院,江蘇无錫 214081) ,  Li Ting (上海海洋大学水産与生命学院,上海 201306;中国水産科学研究院,農業部水生動物基因組重点実験室,北京 100141) ,  Li Yanhong (上海海洋大学水産与生命学院,上海 201306;中国水産科学研究院,農業部水生動物基因組重点実験室,北京 100141) ,  Liu Haijin (中国水産科学研究院,農業部水生動物基因組重点実験室,北京 100141) ,  Yang Runqing (中国水産科学研究院,農業部水生動物基因組重点実験室,北京 100141)
資料名： Zhongguo Shuichan Kexue  (Zhongguo Shuichan Kexue)
巻： 24  号： 3  ページ： 440-448  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2255A  ISSN： 1005-8737  CODEN： ZSKEFS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では、有糸分裂雌核の発育を利用し、ヒラメ(Paralichthys olivaceus)二倍体(Doubled Haploids、DH)群体を樹立した。ヒラメの体重、全長、背鰭の長さ、腹鰭の長さ、高さ、尾柄の高さ、頭の高さと幹の長さの計8組の表現型の標準化処理後、主成分分析を行い、すべての形質の90.4%を説明できる表現型主成分の性状を得た。その後、JoinMap 4、MapDisto、JoinMap 4-DistortedMap、MapDisto-DistortedMapに基づき、4つの連鎖地図を構築した。部分的に分離された量的形質遺伝子座(Quantitative Trait Locus,QTL)の遺伝子型条件の確率を用いて、Bayesianモデル選択方法を用いて、ヒラメの表現型主成分の性状を付加するQTLと上位性QTLを選択した。結果により、異なる方法で構築した遺伝地図と表現型主成分の性状のQTLマッピング結果はいずれも異なることが明らかになった。地図構築において、JoinMap 4に基づいて構築された画像と比べ、MapDistoに基づいて構築された画像中の偏分離標識の相対位置と遺伝距離はいずれも変化し、さらに5つの偏分離マーカーは相応の連鎖群に定位されなかった。JoinMap 4とMapDistoによって構築された画像に対して、DistortedMapによって校正された画像中の偏位標識の相対位置は変化がなかったが、偏分離マーカー間の遺伝距離は変化した。また、4つの地図において、3つのQTLが検出され、それぞれ6号連鎖群に位置し、表現型変異の12.95%、14.85%、11.56%と11.76%、9号、22号の連鎖群において、負の相加効果があった。9番目の連鎖群では,表現型変異の13.86%,13.27%,11.17%と11.25%を説明し,負の相加効果があった。22番目の連鎖群において,表現型変異の5.68%,4.36%,4.97%および3.58%を説明し,正の相加効果を示した。同時に,28対,19対,29対と20対の上位QTLを検出し,主に6号,7号,9号,17号,20号と22号の連鎖群に分布した。それは,表現型の主成分特性の変異の2.19%~17.62%,2.40%~22.26%,2.08%~26.0%,3.16%~22.05%を説明できた。研究結果により、MapDistoソフトウェアに基づいて構築され、DistortedMapソフトウェアによって修正された画像により、定位結果はより正確であるが、さらに検証する必要があることが明らかになった。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ヒラメ ,  相加作用 ,  連鎖地図 ,  体重 ,  ソフトウェア ,  量的形質遺伝子座 ,  画像 ,  主成分分析 ,  遺伝子型 ,  表現型 ,  二倍体
準シソーラス用語： 表現型変異 ,  連鎖群 ,  遺伝距離 ,  QTL解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Paralichthys olivaceus ,  Bayesian model selection ,  distorted segregation ,  additive QTL ,  epistasis QTL ,  MapDisto ,  DistortedMap

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： ヒラメ ,  成長形質 ,  QTL