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J-GLOBAL ID：201702222564495260   整理番号：17A1004406

cooccurNet 共起性ネットワーク構築および解析のためのRパッケージ

cooccurNet: an R package for co-occurrence network construction and analysis

著者 (11件)： ZOU Yuanqiang (Hunan Univ., Changsha, CHN) ,  WU Zhiqiang (Hunan Univ., Changsha, CHN) ,  DENG Lizong (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  DENG Lizong (Suzhou Inst. Systems Medicine, Suzhou, CHN) ,  WU Aiping (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  WU Aiping (Suzhou Inst. Systems Medicine, Suzhou, CHN) ,  WU Fan (Hunan Univ., Changsha, CHN) ,  LI Kenli (Hunan Univ., Changsha, CHN) ,  JIANG Taijiao (Peking Union Medical Coll., Beijing, CHN) ,  JIANG Taijiao (Suzhou Inst. Systems Medicine, Suzhou, CHN) ,  PENG Yousong (Hunan Univ., Changsha, CHN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 12  ページ： 1881-1882  発行年： 2017年06月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノム共起性ネットワークを同定するための計算モデルの利用を促進するため,Rパッケージ,cooccurNetを示した。cooccurNetは,残基(例えば,ヌクレオチド,アミノ酸およびSNP)共起性ネットワークの構築および解析の機能性を含む。そのうえ,残基共起性スコアとして定義される残基共進化を測定するための新しい方法を提案し,共起性ネットワークに基づいたcooccurNetにおいて実施した。

シソーラス用語： 性質 ,  *同時発生 ,  新設 ,  配置 ,  *ネットワーク ,  *プログラミング言語 ,  *プログラムパッケージ ,  *計算モデル ,  *ゲノム ,  ヌクレオチド ,  アミノ酸 ,  一塩基多型 ,  機能 ,  生物進化
準シソーラス用語： *共起性 ,  *ネットワーク構築 ,  *Rパッケージ ,  SNP ,  機能性 ,  共進化

分類 (3件)： 数値計算  (JE02000J) ,  オペレーションズリサーチ一般  (KA03010Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 共起性 ,  ネットワーク構築 ,  解析 ,  Rパッケージ