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J-GLOBAL ID：201702222818636402   整理番号：17A1992738

細胞分化における転写調節パターンの同定

Identification of transcript regulatory patterns in cell differentiation

著者 (3件)： GUSNANTO Arief (Univ. Leeds, Leeds, GBR) ,  GOSLING John Paul (Univ. Leeds, Leeds, GBR) ,  POPE Christopher (Univ. Leeds, Leeds, GBR)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 20  ページ： 3235-3242  発行年： 2017年10月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞分化経路に関する情報を利用して細胞分化に関わる遺伝子を同定する方法について示した。本法では,ベイズモデルを用いて,細胞系列内の分化経路を考慮しながら細胞タイプごとの平均的な遺伝子発現の事後分布を推定する。これにより細胞タイプごとの特異的な遺伝子を推測し,特定の細胞タイプへの分化誘導に関与する遺伝子を同定することが可能となる。本法を造血研究における遺伝子発現データに適用したところ,造血細胞の分化に関わる遺伝子を同定することができた。本法による解析を実行するためのRコードはウェブサイトから入手可能である。

シソーラス用語： *細胞分化 ,  *遺伝子発現 ,  遺伝的調節 ,  *造血 ,  遺伝子 ,  確率分布 ,  シミュレーション ,  事後確率 ,  オントロジー
準シソーラス用語： Bayesモデル ,  遺伝子オントロジー ,  *細胞系列 ,  事後分布 ,  *転写調節 ,  分化誘導

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： 細胞分化 ,  転写調節 ,  同定