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J-GLOBAL ID：201702222847828516   整理番号：17A1754638

マットブタのMEF2A遺伝子の4種類の可変スプライス体のクローニングと生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Bioinformatics Analysis of 4 Alternative Splice Variants of MEF2A Gene in Mashen Pig

著者 (10件)： Zhang Qi (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Guo Xiaohong (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Gao Pengfei (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Jin Yushu (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Li Meng (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Cheng Zhimin (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Zhang Ningfang (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Le Baoyu (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Cao Guoqing (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801) ,  Li Bugao (山西農業大学動物科技学院,太谷,030801)
資料名： Zhongguo Xumu Shouyi  (Zhongguo Xumu Shouyi)
巻： 44  号： 4  ページ： 965-972  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3580A  ISSN： 1671-7236  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,ブタにおける筋細胞強化因子2A(MEF2A)遺伝子の異なるスプライス型をクローン化することである。転写配列決定による可変スプライスの予測結果に基づき、MEF2A遺伝子の第5~8エクソン間のコード領域を増幅し、生物情報学ソフトウェアを用いて、マットブタMEF2A遺伝子の異なるスプライスの配列特性を分析し、保存ドメインを予測し、系統樹を構築した。異なる種のMEF2Aのアミノ酸相同性を比較した。結果により、4つのMEF2A遺伝子のスプライシング体が得られ、MEF2A1の第5~8エクソンが正常にスプライシングされたことが明らかになった。MEF2A2は第5エクソンを欠失し、第6エクソンの5′末端は138bp、第7エクソンの3′末端は102bpが多い。MEF2A3は5番目のエキソンを欠失し,6番目のエキソンの5’末端は138bpを示したが,5番目のエキソンは5番目であった。MEF2A4エキソン7の3′末端は102bpであった。挿入された138bpの配列によってコードされた蛋白質には,1つの保存ドメイン(HJURP_C)があった。これらの結果は,MEF2A1とMEF2A4が,MEF2A1(GenBank登録番号:NP_001090890.1)と同一であり,相同性が98.9%に達することを示した。MEF2A2とMEF2A3はブタのMEF2A2(GenBank登録番号:NP_001093168.1)と同一のサブグループに属し、相同性はそれぞれ98.2%と98.9%であった。本実験では、4つのMEF2A遺伝子のスプライス体をクローニングし、そのタンパク質機能をさらに研究するために基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予測 ,  系統樹 ,  *遺伝子 ,  筋細胞 ,  アミノ酸 ,  相同性 ,  ソフトウェア ,  タンパク質 ,  クローン
準シソーラス用語： 蛋白質機能 ,  GenBank ,  *バイオインフォマティクス ,  *クローニング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Mashen pig ,  MEF2A gene ,  alternative splice ,  bioinformatics

分類 (1件)： 建設施工一般  (RA07010Z)

タイトルに関連する用語 (7件)： マット ,  ブタ ,  遺伝子 ,  可変 ,  クローニング ,  生物情報学 ,  解析