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J-GLOBAL ID：201702223461020073   整理番号：17A1826001

適応進化における遺伝子コピー数変異:野生種,ホワイトスプルース(Picea glauca)の遺伝的マッピングとその適応役割によって明らかにされた遺伝子コピー数多型のゲノム分布【Powered by NICT】

Gene copy number variations in adaptive evolution: The genomic distribution of gene copy number variations revealed by genetic mapping and their adaptive role in an undomesticated species, white spruce (Picea glauca)

著者 (17件)： Prunier Julien (Institute for System and Integrative Biology (IBIS), Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Prunier Julien (Centre for Forest Research, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Caron Sebastien (Institute for System and Integrative Biology (IBIS), Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Caron Sebastien (Centre for Forest Research, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Lamothe Manuel (Laurentian Forest Centre, Canadian Forest Service, Natural Resources Canada, Quebec, QC, Canada) ,  Lamothe Manuel (Canada Research Chair in Forest Genomics, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Blais Sylvie (Institute for System and Integrative Biology (IBIS), Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Blais Sylvie (Centre for Forest Research, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Blais Sylvie (Canada Research Chair in Forest Genomics, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Bousquet Jean (Institute for System and Integrative Biology (IBIS), Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Bousquet Jean (Centre for Forest Research, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Bousquet Jean (Canada Research Chair in Forest Genomics, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Isabel Nathalie (Laurentian Forest Centre, Canadian Forest Service, Natural Resources Canada, Quebec, QC, Canada) ,  Isabel Nathalie (Canada Research Chair in Forest Genomics, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  MacKay John (Centre for Forest Research, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  MacKay John (Canada Research Chair in Forest Genomics, Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  MacKay John (Department of Plant Sciences, University of Oxford, Oxford, UK)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 26  号： 21  ページ： 5989-6001  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子コピー数変動(CNV)は動物と植物における表現型の変動性と関連しているが,表現型に及ぼすそれらの影響の全ゲノム研究は,主としてヒトおよび農業システムに限定されている。そのようなものとして,CNVはほとんど野生種における適応のゲノム構造の研究で考察した。,シロトウヒの遺伝子CNVの遺伝的マッピング,その大きなゲノム(20 Gb)の連続した集合を欠く,と適応表現型変異との関係について報告した。子孫集合におけるアレイ(a CGH)の比較ゲノムハイブリダイゼーション法を用いたde novo構造変化を含む3,911遺伝子CNVを検出した。半数体および二倍体組織および遺伝的マッピング82遺伝子CNVを比較することにより親内でCNV遺伝子座のヘテロ接合性を推定した。著者らの解析は,CNVは10の連鎖グループにわたって分布し,マツ科の他の種で起こることが予測する四CNVホットスポットを同定したことを示した。芽と芽フラッシュのタイミングと回帰分析,および高さ成長に基づく遺伝子CNVと適応形質の29の間に,気候変動への適応におけるCNVの役割を示唆しているは有意に相関した。シロトウヒの適応進化におけるCNVの重要性も機能性遺伝子注釈とCNVホットスポットにおけるマップ適応遺伝子CNVの31%のクラスタ化により示唆された。まとめると,これらの結果は野生種におけるCNVの研究の実現可能性を説明し,適応進化におけるCNVの役割のより良い理解に向けての大きなステップを示した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  クラスタ化 ,  *変異 ,  *ゲノム ,  *遺伝子 ,  動物 ,  ヒト ,  *遺伝 ,  表現型 ,  ホットスポット ,  *コピー数 ,  二倍体
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  *野生種 ,  *適応進化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 適応進化 ,  アレイの比較ゲノムハイブリダイゼーション ,  遺伝子はコピー数変動 ,  遺伝的マッピング ,  ゲノム構造 ,  裸子植物

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (14件)： 適応進化 ,  遺伝子 ,  コピー数 ,  変異 ,  野生種 ,  ホワイト ,  スプルース ,  Picea ,  マッピング ,  適応 ,  役割 ,  コピー数多型 ,  ゲノム ,  分布