文献

J-GLOBAL ID：201702223682567315   整理番号：17A1166425

STR DNAタイピングのためのCE-LIFにおける確率的ピーク検出【Powered by NICT】

Probabilistic peak detection in CE-LIF for STR DNA typing

著者 (7件)： Woldegebriel Michael (Analytical Chemistry, Van’t Hoff Institute for Molecular Sciences, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  van Asten Arian (Analytical Chemistry, Van’t Hoff Institute for Molecular Sciences, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  van Asten Arian (Netherlands Forensic Institute, The Hague, The Netherlands) ,  van Asten Arian (CLHC, Amsterdam Center for Forensic Science and Medicine, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Kloosterman Ate (Netherlands Forensic Institute, The Hague, The Netherlands) ,  Kloosterman Ate (CLHC, Amsterdam Center for Forensic Science and Medicine, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Vivo-Truyols Gabriel (Analytical Chemistry, Van’t Hoff Institute for Molecular Sciences, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands)
資料名： Electrophoresis  (Electrophoresis)
巻： 38  号： 13-14  ページ： 1713-1723  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0626B  ISSN： 0173-0835  CODEN： ELCTDN  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,法医学的DNA解析のためのBayesフレームワークに基づく新しい確率的ピーク検出アルゴリズムを提案した。提案した方法はレーザ誘起蛍光多CEシステムからの生電気泳動図データの徹底的な利用を目的とした。生データは,単一データ点まで情報として,従来の閾値に基づくアプローチは,データ解析パイプラインにおける初期関連法医学情報を廃棄する。著者らの提案した方法は,ピーク検出基準に関してデータ点の関連性を反映した事後確率を割り当てる。真に既存対立遺伝子から発生する低強度のピークは,それらを廃棄と潜在的対立遺伝子ドロップアウトを考慮完全の証拠値を構成することができる。加工のこの方法は,各個々のデータ点の中で利用可能な情報を利用しており,したがって誤差伝搬をもたらすことをデータ解析に及ぼす初期(二元)決定を回避した。法医学STR DNAプロファイリングで現在慣例となっているとして提案した方法を試験し,設定しきい値の応用と比較した。新しい方法は,同定された対立遺伝子の数において大幅な改善をもたらす,Gauss形状からのピーク高さと偏差に関係なくことが分かった。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 医学情報 ,  法医学 ,  *DNA【核酸】 ,  事後確率 ,  対立遺伝子 ,  データ解析
準シソーラス用語： プロファイリング ,  誤差伝搬 ,  生データ ,  エレクトロフェログラム ,  レーザ誘起蛍光 ,  検出アルゴリズム ,  DNA解析 ,  *ピーク検出 ,  *タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Bayes統計 ,  法 ,  ピーク検出 ,  確率 ,  STR分析

分類 (3件)： 電気泳動分析  (CC04017K) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： STR ,  DNAタイピング ,  Ce ,  LIF ,  確率 ,  ピーク検出