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J-GLOBAL ID：201702223736675373   整理番号：17A1388227

in silico予測の比較と胆道疾患患者で同定されたABCB4変異体の実験的評価【Powered by NICT】

Comparison of in silico prediction and experimental assessment of ABCB4 variants identified in patients with biliary diseases

著者 (11件)： Khabou Boudour (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, INSERM, UMR_S 938, Centre de Recherche Saint-Antoine, F-75012, Paris, France) ,  Khabou Boudour (Laboratoire de Genetique Moleculaire Humaine, Faculte de Medecine, Universite de Sfax, Tunisie) ,  Durand-Schneider Anne-Marie (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, INSERM, UMR_S 938, Centre de Recherche Saint-Antoine, F-75012, Paris, France) ,  Delaunay Jean-Louis (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, INSERM, UMR_S 938, Centre de Recherche Saint-Antoine, F-75012, Paris, France) ,  Aiet-Slimane Tounsia (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, INSERM, UMR_S 938, Centre de Recherche Saint-Antoine, F-75012, Paris, France) ,  Barbu Veronique (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, INSERM, UMR_S 938, Centre de Recherche Saint-Antoine, F-75012, Paris, France) ,  Barbu Veronique (Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Hopital Saint-Antoine, Centre de Reference Maladies Rares, Maladies Inflammatoires des Voies Biliaires, F-75012, Paris, France) ,  Fakhfakh Faiza (Laboratoire de Genetique Moleculaire et Fonctionnelle, Faculte des Sciences de Sfax, Universite de Sfax, Tunisie) ,  Housset Chantal (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, INSERM, UMR_S 938, Centre de Recherche Saint-Antoine, F-75012, Paris, France) ,  Housset Chantal (Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Hopital Saint-Antoine, Centre de Reference Maladies Rares, Maladies Inflammatoires des Voies Biliaires, F-75012, Paris, France) ,  Maurice Michele (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, INSERM, UMR_S 938, Centre de Recherche Saint-Antoine, F-75012, Paris, France)
資料名： International Journal of Biochemistry & Cell Biology  (International Journal of Biochemistry & Cell Biology)
巻： 89  ページ： 101-109  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0255C  ISSN： 1357-2725  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ホスファチジルコリン輸送体ABCB4の遺伝的変異は,何種類かの胆管疾患を引き起こす。報告された変化の大多数は,各変動の包括的研究を予測を困難にしている。in silico予測プログラムの信頼性を評価するために,1)著者らは低リン脂質関連胆石症(LPAC)患者で同定された二ABCB4変動(E528DとP1161S)の細胞モデルにおける評価と直面2)19変化への直面を拡張し我々は以前in celluloで特性を示した。四プログラム(Provean,Polyphen2,PhD SNPとMutPred)は病原性の程度を予測するために使用した。E528DとP1161S変異体は免疫蛍光,免疫ブロッティングおよびホスファチジルコリン分泌の測定をトランスフェクトした,HEK293細胞およびHepG2細胞で検討した。全ての予測ツールは有害としてP1161S変動と認められたが,E528Dの矛盾する結果を提供した。細胞モデルでは,両変異体は野生型として発現し,局在していたが,それらの活性は有意に減少し,48%(P1161S)と33%(E528D)であった。これらの機能欠陥はMutPred予測と最も良く相関した。MutPredプログラムは,以前に細胞モデルで特性化する19ABCB4変異体の病原性とヒト遺伝子突然変異データベースの65付加的変異の病原性を予測するための最も感受性を予測する最も正確なを証明した。これらの結果は,E528DとP1161S変動の病原性を確認し,もホスファチジルコリン分泌の緩やかな低下(50%以下)はLPAC症候群を引き起こす可能性があることを示唆した。in silico予測ツールの信頼性,特にMutPredを強調し,ABCB4変異体の病原性を予測するための最初のアプローチ。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ヒト ,  *変異 ,  HepG2細胞 ,  *患者 ,  遺伝子 ,  レシチン ,  *予測 ,  感受性 ,  病原性 ,  突然変異 ,  分泌 ,  キャラクタリゼーション ,  データベース
準シソーラス用語： 細胞モデル ,  *in silico , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 胆汁うっ滞 ,  ABC輸送体 ,  MDR3 ,  遺伝子病 ,  MutPred予測

分類 (3件)： 生物薬剤学(基礎)  (GY01021U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  薬物の構造活性相関  (GV01050B)

タイトルに関連する用語 (8件)： 予測 ,  胆道 ,  疾患患者 ,  同定 ,  ABCB4 ,  変異体 ,  実験 ,  評価